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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000217`

染色体: Chr08 坐标: 1480648-1484225 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000217`
名称	SmilChr08G000217
描述	zinc finger protein HD1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1480648 - 1484225 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999829`
GeneID	`130999829`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999829`
原始查询	`SmilChr08G000217`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein HD1-like
产物	zinc finger protein HD1-like
Arabidopsis	`AT1G04500` (AT1G04500) CCT motif family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839510] identity=38.8; qcov=1.07; evalue=4.68e-63; confidence=medium
Rice	`Os03g0139500` (OsCCT10) - identity=39.8; qcov=0.662; evalue=1.63e-43; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0009909 (regulation of flower development)
KEGG	-
Pfam	PF06203 (CCT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999829

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781480.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781480.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781480.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781480.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057781480.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1480909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B29,B51,C15,C35
`Chr8:1480945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr8:1481467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C29,C64,C66,C71,C77
`Chr8:1481892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,B93,C56
`Chr8:1481958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:1482030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr8:1482033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,B93,C56
`Chr8:1482358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B134,C79
`Chr8:1482395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr8:1482404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B24,B26,B72,C52
`Chr8:1482416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B104,B24,B7
`Chr8:1482446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B123,C16,C33,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781480.1

404 aa

202

404

CCT

PF06203 CCT 293-335 aa

XP_057781482.1

403 aa

202

403

CCT

PF06203 CCT 292-334 aa

XP_057781483.1

400 aa

200

400

CCT

PF06203 CCT 289-331 aa

XP_057781484.1

399 aa

200

399

CCT

PF06203 CCT 288-330 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781480.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	293	335	8.4e-18	64.9	CCT motif
`XP_057781482.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	292	334	8.4e-18	64.9	CCT motif
`XP_057781483.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	289	331	8.3e-18	64.9	CCT motif
`XP_057781484.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	288	330	8.2e-18	64.9	CCT motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925501.1
TCTTAATCTCTCTAAAAATTCCAAACCAAGAAAGAGCCAAATTATAAAAAAAATAAAAATAAACAAAAGAGCCTTTCACTTTCTGTCCAATCGTTTTAGTTTGAAGTTTTTGGTGCCATTTGTTTTGACGTTTAATTCCAACCTCTGAATTAAATCAAAAGTGGCCATGAGAAAAATGTTGAGATGGTTCATCCACAAGATCAACAACTCTCCATTGAGGAATTCAGCAACCCCAATATTGGAAGCCATTTATTGGAATT...

XM_057925500.1
TCTTAATCTCTCTAAAAATTCCAAACCAAGAAAGAGCCAAATTATAAAAAAAATAAAAATAAACAAAAGAGCCTTTCACTTTCTGTCCAATCGTTTTAGTTTGAAGTTTTTGGTGCCATTTGTTTTGACGTTTAATTCCAACCTCTGAATTAAATCAAAAGTGGCCATGAGAAAAATGTTGAGATGGTTCATCCACAAGATCAACAACTCTCCATTCAGGAGGAATTCAGCAACCCCAATATTGGAAGCCATTTATTGGA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130999829
ATGTTGCAGGAGATGGTTCATCCACAAGATCAACAACTCTCCATTGAGGAATTCAGCAACCCCAATATTGGAAGCCATTTATTGGAATTCAGTGAGTCTGAATTATTCCCAGAGACTGTCCAAAATTCTGAAGTTGGCTCAAACACCTATGATCATGAAAAACAATCTTCTTATCAAATACAACTCTCTAATATTACTGTTGAAATGAGTAACTTCAACACTTCAACTAACATAGACGACGAAATCAAGCCGCCACCGCC...

LOC130999829
ATGTTGCAGGAGATGGTTCATCCACAAGATCAACAACTCTCCATTCAGGAGGAATTCAGCAACCCCAATATTGGAAGCCATTTATTGGAATTCAGTGAGTCTGAATTATTCCCAGAGACTGTCCAAAATTCTGAAGTTGGCTCAAACACCTATGATCATGAAAAACAATCTTCTTATCAAATACAACTCTCTAATATTACTGTTGAAATGAGTAACTTCAACACTTCAACTAACATAGACGACGAAATCAAGCCGCCACC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057781480.1
MLQEMVHPQDQQLSIQEEFSNPNIGSHLLEFSESELFPETVQNSEVGSNTYDHEKQSSYQIQLSNITVEMSNFNTSTNIDDEIKPPPPPPPIVAAAGTLFDEENDISAAIDFTTSPSFSHHQYISNNSSSNNNNNNIDNNNDNDASQEAFDISSLNGQLDMTAASGWAAAGPYEEECMSSFMRMKASQPLIDSIMVPYLGPPPGIPFTTSTQSSGAFMGMQDLEFQGDNAAFFIPDNMQRAFNCPTDLQGLSNESQHLYH...

XP_057781482.1
MLQEMVHPQDQQLSIEEFSNPNIGSHLLEFSESELFPETVQNSEVGSNTYDHEKQSSYQIQLSNITVEMSNFNTSTNIDDEIKPPPPPPPIVAAAGTLFDEENDISAAIDFTTSPSFSHHQYISNNSSSNNNNNNIDNNNDNDASQEAFDISSLNGQLDMTAASGWAAAGPYEEECMSSFMRMKASQPLIDSIMVPYLGPPPGIPFTTSTQSSGAFMGMQDLEFQGDNAAFFIPDNMQRAFNCPTDLQGLSNESQHLYHG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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