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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000219`

染色体: Chr08 坐标: 1492764-1493609 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000219`
名称	SmilChr08G000219
描述	uncharacterized SmilChr08G000219
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1492764 - 1493609 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997031`
GeneID	`130997031`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997031`
原始查询	`SmilChr08G000219`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plant viral-response family protein (DUF716) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831236]; symbol=AT5G13890; hit=AT5G13890; species=arabidopsis; confidence=low
产物	plant viral-response family protein (DUF716) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831236]; symbol=AT5G13890; hit=AT5G13890; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G13890` (AT5G13890) plant viral-response family protein (DUF716) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831236] identity=28.4; qcov=0.89; evalue=1.35e-12; confidence=low
Rice	`Os06g0238900` - identity=27.8; qcov=0.473; evalue=2.37e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04819 (DUF716)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997031

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057778293.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057778293.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057778293.1`
4	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057778293.1`
5	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057778293.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1492815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C57
`Chr8:1492919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:1493060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr8:1493151`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B21
`Chr8:1493151`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B21
`Chr8:1493199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B29,B51,C15,C37
`Chr8:1493264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr8:1493272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr8:1493273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr8:1493279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr8:1493320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr8:1493327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778293.1

281 aa

140

281

DUF716

PF04819 DUF716 119-249 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778293.1`	Pfam	`PF04819`	DUF716	Family	119	249	1.1e-21	77.6	Family of unknown function (DUF716)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922310.1
ATGTCAACGACGTCGTTAGCTACCCATTTCACGGCATCCCTCCTCCTCTGCCCCCTCGGCCTCCGCCGCCTCCTCTGCTCCTCCTCTCTCTACCTCACCAACCCTTCTCTCTACCGATCAAGAACATGGTATTTCTCCCAATCCAACTGGAAAACCCTCGATATCTACTCACTCCTAATTCTCCTCCCAATCGCCTCGCTCTCCCACATCGTCTTCTTCCTCGCAATTTCCGAATCCCCAATTCACAAATTCTCATTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997031
ATGTCAACGACGTCGTTAGCTACCCATTTCACGGCATCCCTCCTCCTCTGCCCCCTCGGCCTCCGCCGCCTCCTCTGCTCCTCCTCTCTCTACCTCACCAACCCTTCTCTCTACCGATCAAGAACATGGTATTTCTCCCAATCCAACTGGAAAACCCTCGATATCTACTCACTCCTAATTCTCCTCCCAATCGCCTCGCTCTCCCACATCGTCTTCTTCCTCGCAATTTCCGAATCCCCAATTCACAAATTCTCATTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778293.1
MSTTSLATHFTASLLLCPLGLRRLLCSSSLYLTNPSLYRSRTWYFSQSNWKTLDIYSLLILLPIASLSHIVFFLAISESPIHKFSFLQQSFVISLFWVILILIVAKESFDLCSFLPDNLVFAFAAIAFLIEFYMAGRGLIGFGVWLYRILGYFTLLCAGCCLCLSVRPSAFFAEFLLSCGLVLKGSWVLQVGLSLYTDAFGLKGCGKIERGEADVKCELDDDVWRGVALVNLVFVGHVIVVIVIGFVSFGLLHNRKRGEG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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