当前解析结果
SmilChr08G000236| 统一新 Gene ID | SmilChr08G000236 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000236 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G000236 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 1613188 - 1617854 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130997036 |
|---|---|
| GeneID | 130997036 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997036 |
| 原始查询 | SmilChr08G000236 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997036 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057778298.1 |
| 2 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.40000 | XP_057778298.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057778298.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057778298.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057778298.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:1613852 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A21,D3 |
Chr8:1613855 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B15,B48,C28,C38 |
Chr8:1613855 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B15,B48,C28,C38 |
Chr8:1613902 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B136 |
Chr8:1613929 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr8:1613948 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr8:1613968 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A4,B81 |
Chr8:1613985 |
AAC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 63 | A1,A10,A16,A18,A19,A2,A21,A4,A5,B100,B109,B11,B114,B117,B123,B126,B130,B132,B135,B137,B15,B20,B21,B24,B28,B38,B4,B41,B45,B52,B56,B59,B64,B73,B79,B82,B92,B97,C1,C11,C15,C19,C20,C29,C3,C30,C36,C37,C42,C5,C50,C54,C59,C6,C60,C61,C67,C72,C75,C79,D2,D8,D9 |
Chr8:1613990 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A1,A14,B27,B51,B89 |
Chr8:1614062 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr8:1614121 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A5,B14,B66 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。