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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000243`

染色体: Chr08 坐标: 1678160-1699852 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000243`
名称	SmilChr08G000243
描述	putative disease resistance protein RGA3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1678160 - 1699852 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999813`
GeneID	`130999813`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999813`
原始查询	`SmilChr08G000243`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance protein RGA3
产物	putative disease resistance protein RGA3
Arabidopsis	`AT3G14470` (AT3G14470) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820670] identity=32; qcov=0.927; evalue=9e-116; confidence=low
Rice	`Os05g0492200` (YR1) - identity=32.7; qcov=0.943; evalue=7.1e-124; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF05729 (NACHT); PF18052 (Rx_N); PF23247 (LRR_RPS2); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14); PF25019 (LRR_R13L1-DRL21)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999813

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057781451.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057781451.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781451.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781451.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781451.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1679019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr8:1679081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr8:1679160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C37,C43
`Chr8:1679224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr8:1679226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr8:1679227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr8:1679241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B14,B89,C80,D8
`Chr8:1679289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr8:1679320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,B29,B35,B72,C15
`Chr8:1679370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr8:1680489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr8:1680540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781451.1

1031 aa

516

1031

Rx_N

NB-ARC

NACHT

WHD_DRP

LRR_14

LRR_R13L1-DRL21

LRR_RPS2

PF18052 Rx_N 9-96 aa PF00931 NB-ARC 180-351 aa PF05729 NACHT 199-343 aa PF23559 WHD_DRP 432-503 aa PF23598 LRR_14 581-900 aa PF25019 LRR_R13L1-DRL21 700-834 aa PF23247 LRR_RPS2 802-919 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781451.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	9	96	2.9e-21	76.1	Rx N-terminal domain
`XP_057781451.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	180	351	1.3e-34	120.0	NB-ARC domain
`XP_057781451.1`	Pfam	`PF05729`	NACHT	Domain	199	343	3.3e-06	27.8	NACHT domain
`XP_057781451.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	432	503	2.1e-25	89.3	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057781451.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	581	900	5.2e-32	111.7	Leucine-rich repeat region
`XP_057781451.1`	Pfam	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	Repeat	700	834	1.9e-35	122.2	R13L1/DRL21 LRRs
`XP_057781451.1`	Pfam	`PF23247`	LRR_RPS2	Repeat	802	919	1e-10	42.5	Plant disease resistance protein RPS2-like, leucine-rich repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925468.1
ACTCATCCAATTCTGCTCCTTAATCCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTAAGTTATCAGCTAACACAAAGCAAGGAAGCAACCGTCATTAAAGCGCAGTAGGGAAGTTATCAGCTAGCACAAAGCATGGAAGCAGCAGCTGCTACCGCCGTCCTTAAAGTTCTAGTTGAAAAACTCATCGACCTCCCCATGAAAGAGATCTCTCAAATCCGAGGTTTCCGCAAAAATGCAGAAAAGCTAGCTGGAAGTCTCGACATGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999813
ATGGAAGCAGCAGCTGCTACCGCCGTCCTTAAAGTTCTAGTTGAAAAACTCATCGACCTCCCCATGAAAGAGATCTCTCAAATCCGAGGTTTCCGCAAAAATGCAGAAAAGCTAGCTGGAAGTCTCGACATGATCAAAAATTTCTTGAACGATGCTGAGATGCGTGCCATCACCACCGATGCTGCTGTCAAGAGCTGGTTGAAGAAGCTTGAAGACGTGGCGTTCGATGCTGACAATGTTTTGGATGAAATCAACTATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781451.1
MEAAAATAVLKVLVEKLIDLPMKEISQIRGFRKNAEKLAGSLDMIKNFLNDAEMRAITTDAAVKSWLKKLEDVAFDADNVLDEINYHILSKQIKATKPMKAKILTGFSSSVNSIAHPRNMAVKIQEINENLESIKKEATDLGLVVRLAIANEPTLVDASLETDSYTLDPIFIGRDDAVSEIVEMLTNSITTDERAVSIISIVGMGGLGKTTLTRKVFNHLKDENQFGLHIWVHVSRNFDAITLLKTILKNLTPCQVENAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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