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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000272`

染色体: Chr08 坐标: 1858264-1861514 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000272`
名称	SmilChr08G000272
描述	F-box protein SKIP16-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1858264 - 1861514 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999862`
GeneID	`130999862`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999862`
原始查询	`SmilChr08G000272`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein SKIP16-like
产物	F-box protein SKIP16-like
Arabidopsis	`AT1G06110` (SKIP16) SKP1/ASK-interacting protein 16 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837120] identity=59.8; qcov=1; evalue=3.71e-164; confidence=high
Rice	`Os11g0265200` - identity=57; qcov=1.01; evalue=5.86e-139; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04379 (DUF525)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999862

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781523.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057781523.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057781523.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781523.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781523.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1859537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B62,B70,C15
`Chr8:1859562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,C15
`Chr8:1859563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C31
`Chr8:1859589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:1859812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B61,B64
`Chr8:1859891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B100,B82,C50,C60
`Chr8:1859922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr8:1859925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:1859995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B86,C64
`Chr8:1860201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B14,B65,B67,C50
`Chr8:1860216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr8:1860237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781523.1

364 aa

182

364

DUF525

PF04379 DUF525 243-336 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781523.1`	Pfam	`PF04379`	DUF525	Family	243	336	8e-23	81.2	ApaG domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925540.1
CGCCCCTTCGTTCAAGGCAGCTTATCAAGCATGGCGAGAAAGCTTTTCCATGTATCCATGGCCACTAGTCTTACGGGTTAAAAGGTGTTGGAGCAAGATTAGGGCATGGTTGGCAGTAAACTTTCCAGAGGCTTCGCCAACTCTGCGCAAAGGCGCGTCAGAAGAGGAGATTGAGGATTTTGAGAAAACTTTGAAGGTAAAACTGCCGCTTCCTACGAGGGTACTCTACCGATTCTGTGATGGTCAAGTGCTGCCGGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999862
ATGTATCCATGGCCACTAGTCTTACGGGTTAAAAGGTGTTGGAGCAAGATTAGGGCATGGTTGGCAGTAAACTTTCCAGAGGCTTCGCCAACTCTGCGCAAAGGCGCGTCAGAAGAGGAGATTGAGGATTTTGAGAAAACTTTGAAGGTAAAACTGCCGCTTCCTACGAGGGTACTCTACCGATTCTGTGATGGTCAAGTGCTGCCGGATGAAGGTTTCAGTGGAGGCATGCCGTCAAGTTTGTTGGGTATAATTGGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781523.1
MYPWPLVLRVKRCWSKIRAWLAVNFPEASPTLRKGASEEEIEDFEKTLKVKLPLPTRVLYRFCDGQVLPDEGFSGGMPSSLLGIIGGYTLYDHLVNVFLLPLSQIVVDTKSIMHQIGLSSRSNYVVVAASATYSEKVFFLNCGSGQLFVGTRNLVTDGEMLPCVPDTLISSVHDRLGSEQQDAMLLWLEEHGRRLQEGLIKVRQQGKMRSINLFPEEPPLCTSAITNGVKVRASAVFLPEFSNLQDESEKFLFAYSIRMS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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