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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000277`

染色体: Chr08 坐标: 1891306-1894945 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000277`
名称	SmilChr08G000277
描述	F-box protein SKIP16-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1891306 - 1894945 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999867`
GeneID	`130999867`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999867`
原始查询	`SmilChr08G000277`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein SKIP16-like
产物	F-box protein SKIP16-like
Arabidopsis	`AT1G06110` (SKIP16) SKP1/ASK-interacting protein 16 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837120] identity=59.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0265200` - identity=55.5; qcov=1; evalue=1.22e-161; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF04379 (DUF525)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999867

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057781532.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057781532.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057781532.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781532.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781532.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1891600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr8:1891610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A19,B3,B5,C72
`Chr8:1891613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,B54
`Chr8:1891615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B70,C15,C23,C76
`Chr8:1891624`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B2
`Chr8:1891624`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B2
`Chr8:1892584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr8:1892609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B38,C15,C17
`Chr8:1892618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B38,B93,C17
`Chr8:1892633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B18,B75,C43
`Chr8:1892634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C52
`Chr8:1892636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C8,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781532.1

443 aa

222

443

DUF525

PF04379 DUF525 323-415 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781532.1`	Pfam	`PF04379`	DUF525	Family	323	415	1.1e-22	80.7	ApaG domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925549.1
CTCCCGAATATAAACGATATCGACGTCTTCAAATTTTCTCATTTTTTATGAACAAAAATCTCGACAGCGAAAACAACCATACAAACAAGGACAAGTCACACTCACCGCTTCTCTCCCCCAATTAAACCCCATTTCCTTTCTCTCTCAAAATCTCACAACAATTTGCTGCAAATTCGAACAATCGATAGCTCAGAACCACTGCAGCCGAAAGCTATGGGTTTGGAGAGCGTGGGCGGGCTGGCGATGCACGTTATCCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999867
ATGGGTTTGGAGAGCGTGGGCGGGCTGGCGATGCACGTTATCCTCTCCAAATCGGGCCCCGGCGAAGCCGCCTCCGTCGCCTGCCTCGGCAGGCGATTTCGGGCCTGGGCCTCCGATGACATGCTATGGGCTCAATTCTGCTCGCACGAGCTCGATCTCACCTCCCCTCTTGATCCCGATGGGAGTCCCGCCCCTTCGTTCAAGGCAGCTTATCAAGCATGGCGAGAAAGCTTTTCCATGTATCCATGGCCACTAGTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781532.1
MGLESVGGLAMHVILSKSGPGEAASVACLGRRFRAWASDDMLWAQFCSHELDLTSPLDPDGSPAPSFKAAYQAWRESFSMYPWPLVLRVKRCWSKIRAWLVVNFPEASPTLRKGASEEEIEDFEKTLKVKLPLPTRVLYRFCDGQVLPDEGFSGGMPSSLLGIIGGYTLYDHLVNVFLLPLSQIVVDTKSIMHQIGLSSRSNYVVVAASATYSEKVFFLNCGSGQLFVGTRNLVTDGEMLPCVPDTLISSVHDRLGSEQQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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