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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000287`

染色体: Chr08 坐标: 1954142-1956432 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000287`
名称	SmilChr08G000287
描述	protein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 13
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1954142 - 1956432 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999878`
GeneID	`130999878`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999878`
原始查询	`SmilChr08G000287`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 13
产物	protein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 13
Arabidopsis	`AT3G59530` (LAP3) Calcium-dependent phosphotriesterase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825122] identity=67.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0263600` (OsSTRL2) - identity=65.9; qcov=0.976; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009058 (biosynthetic process); GO:0016844 (strictosidine synthase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03088 (Str_synth); PF08450 (SGL); PF20067 (SSL_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999878

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057781548.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057781548.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057781548.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781548.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781548.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1954311`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C80
`Chr8:1954311`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C80
`Chr8:1954317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr8:1954476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B103,B52,C63
`Chr8:1954544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B75,C51,C82
`Chr8:1954550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr8:1954556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B74
`Chr8:1954562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:1954589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A2,A22,A9,B98
`Chr8:1954660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B136,C78
`Chr8:1954662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr8:1954667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781548.1

409 aa

204

409

SSL_N

SGL

Str_synth

PF20067 SSL_N 69-108 aa PF08450 SGL 137-315 aa PF03088 Str_synth 198-284 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781548.1`	Pfam	`PF20067`	SSL_N	Repeat	69	108	1.3e-05	25.6	Strictosidine synthase-like, N-terminal
`XP_057781548.1`	Pfam	`PF08450`	SGL	Repeat	137	315	1.3e-18	68.2	SMP-30/Gluconolactonase/LRE-like region
`XP_057781548.1`	Pfam	`PF03088`	Str_synth	Repeat	198	284	3.1e-30	104.9	Strictosidine synthase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925565.1
ACAAACACAATAAGTATGACATATATATTACATGTAGTGATTTTAGTATAAAACCTAGCTACTCCCAAACCACACAAAGCCCATCACAAAAATATCATGAGCAATTTCATCATCTCTCTCTTATAATAACGCTCCAATTAATCCCACATTAACGAAAAACTTTTCTTGATCATCATCATCAATTCATGGAGAAGAGAATACTTCGTCACCTTCGAAATGGGCTTCTCTTGCAGCATCCCTTCATTCTTCTCTTCATCTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999878
ATGGAGAAGAGAATACTTCGTCACCTTCGAAATGGGCTTCTCTTGCAGCATCCCTTCATTCTTCTCTTCATCTTGGCATTGAGTTTCATCGCGATGGACCCTTTCGGGCTGAGCCCGGTCGCAGGCCGGGACTTCCGGCCCGTGAGAAACGACATCGCTCCTTATAGGAGAGTGATGGAGAGCTGGCCTTGGGACGACCGGAGCCGCTTGGGGCAGGGCACTCTGCTCTTCAAGAACGAGACGTTCGGGCCCGAGTCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781548.1
MEKRILRHLRNGLLLQHPFILLFILALSFIAMDPFGLSPVAGRDFRPVRNDIAPYRRVMESWPWDDRSRLGQGTLLFKNETFGPESLEFDASGRGPYAGLADGRVVRWMGEDVGWETFALVSPKWSENVCAKGVNSTTKKQWKVEAECGRPLGLRFDVKSGNLYIADAYFGLMVVGAEGGLATPLATHVDGQPILFANDLDIHENGSIFFTDSSTRYNRVNHFFILLEGESTGRLLRYDPHTKTTHVVYKGMAFPNGVQL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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