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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000288`

染色体: Chr08 坐标: 1961628-1966476 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000288`
名称	SmilChr08G000288
描述	disease resistance protein RGA2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1961628 - 1966476 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999879`
GeneID	`130999879`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999879`
原始查询	`SmilChr08G000288`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RGA2-like
产物	disease resistance protein RGA2-like
Arabidopsis	`AT3G14470` (AT3G14470) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820670] identity=28.4; qcov=0.766; evalue=4.47e-44; confidence=low
Rice	`Os10g0130600` - identity=27.4; qcov=1.04; evalue=2.9e-48; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14); PF25019 (LRR_R13L1-DRL21)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999879

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781549.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057781549.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057781549.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057781549.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781549.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1961799`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	107	A10,A11,A14,A15,A18,A19,A2,A22,A25,A3,A4,A8,A9,B10,B104,B107,B110,B115,B117,B119,B12,B120,B121,B131,B133,B137,B140,B16,B17,B18,B2,B23,B28,B32,B36,B37,B4,B40,B42,B45,B48,B5,B52,B55,B56,B57,B59,B65,B74,B76,B77,B83,B85,B87,B89,B9,B90,B92,B93,B94,B98,B99,C11,C14,C16,C17,C18,C19,C2,C21,C22,C24,C25,C26,C27,C30,C33,C4,C41,C43,C46,C49,C53,C54,C56,C57,C6,C60,C63,C65,C69,C7,C75,C76,C77,C79,C8,C82,C85,C87,D1,D10,D11,D2,D5,D7,D9
`Chr8:1961844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,B68,C24
`Chr8:1962913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:1963030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr8:1963062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,C4
`Chr8:1963078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr8:1963084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr8:1963098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,C4
`Chr8:1963108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,C4
`Chr8:1963146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,B32,B51,C73
`Chr8:1963172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C20,C64,C66,C76
`Chr8:1963210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B94,C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781549.1

769 aa

384

769

WHD_DRP

LRR_14

LRR_R13L1-DRL21

PF23559 WHD_DRP 1-55 aa PF23598 LRR_14 91-388 aa PF25019 LRR_R13L1-DRL21 213-350 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781549.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	1	55	1.2e-14	54.7	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057781549.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	91	388	3.5e-37	128.7	Leucine-rich repeat region
`XP_057781549.1`	Pfam	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	Repeat	213	350	1.2e-49	168.2	R13L1/DRL21 LRRs

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925566.1
CTTCTCCGGTTTGCACCAAGTCTTCTCTCTCTCATCTCATTTGCATACACACATAGCAGAAAGAATTTGCACCAACTCCCTCTCTCCTTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACAAAGAGCAGAAACAATGGAAGGAGAAGCTGCTGCAGCCATCCTTCAAGTTCTTGTTCAAAACCTCATCGACCATTCCAAGAAAGAAATCTCACTAATCCGAGGTCTCGACAAAGAAGCAGCAAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999879
ATGGCAGAAGGATTTCTTCGACCTGATGGAGACGAAGACATGGAGTCCGTGGGCGACAAATTCATCAACGTTCTTCTACACAACTCTTTACTGCAAGCTTCACTGAGAGATGATTATGGAAATGTGGAAGGTTGTGTGATGCATGATCTCGTGCATGATCTAGCATGCTCTGTTTTAGGTAACGAAGGCGACATGGAACGAGTTCGTTACTTGATCTCCGAAGAATCAAGCTCTGTGCCAAAGGGAGTTGCAAAATATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781549.1
MAEGFLRPDGDEDMESVGDKFINVLLHNSLLQASLRDDYGNVEGCVMHDLVHDLACSVLGNEGDMERVRYLISEESSSVPKGVAKYLRTLIFKGNISRNMFSDYECLHVLTLDSFGLKELPSQIRELIHLRNLDISYTRIEYLPDWIGELCHLQTFTAEKGFLKKMPSTTKYLINLRHLHIFSDVDLPAEIGRLTSLQTLTHFRVGDQNGCTIEELGSLNNLKGEIQIDGLEMVRDKEDAERANLFRKAKLIDLCLRWDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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