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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000289`

染色体: Chr08 坐标: 1964997-1966328 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000289`
名称	SmilChr08G000289
描述	putative disease resistance protein RGA3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1964997 - 1966328 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997052`
GeneID	`130997052`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997052`
原始查询	`SmilChr08G000289`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance protein RGA3
产物	putative disease resistance protein RGA3
Arabidopsis	`AT3G14470` (AT3G14470) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820670] identity=31; qcov=1.01; evalue=8.63e-48; confidence=low
Rice	`Os05g0492200` (YR1) - identity=34.2; qcov=0.977; evalue=2.39e-61; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF05729 (NACHT); PF13401 (AAA_22); PF18052 (Rx_N); PF20703 (nSTAND1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997052

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057778314.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778314.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778314.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778314.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778314.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1965016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B14
`Chr8:1965020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B52,C23,C48,C71,C82
`Chr8:1965023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B3,B76,B9,D4
`Chr8:1965044`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B117
`Chr8:1965044`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B117
`Chr8:1965052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr8:1965069`	`TG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A7,B19,C10,D11
`Chr8:1965099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr8:1965125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B70
`Chr8:1965128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B111,B69,D2
`Chr8:1965141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	46	A14,A3,B1,B101,B106,B110,B118,B131,B132,B138,B14,B15,B22,B23,B33,B40,B41,B49,B53,B56,B6,B60,B67,B71,B75,B77,B78,B8,B86,B88,B89,B98,C1,C13,C16,C20,C25,C32,C33,C44,C53,C68,C72,C80,D1,D7
`Chr8:1965159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778314.1

443 aa

222

443

Rx_N

nSTAND1

NB-ARC

NACHT

AAA_22

PF18052 Rx_N 10-94 aa PF20703 nSTAND1 168-315 aa PF00931 NB-ARC 189-347 aa PF05729 NACHT 197-339 aa PF13401 AAA_22 198-283 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778314.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	10	94	2.2e-21	76.5	Rx N-terminal domain
`XP_057778314.1`	Pfam	`PF20703`	nSTAND1	Domain	168	315	5.4e-07	30.3	Novel STAND NTPase 1
`XP_057778314.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	189	347	4.7e-37	127.9	NB-ARC domain
`XP_057778314.1`	Pfam	`PF05729`	NACHT	Domain	197	339	4.1e-07	30.7	NACHT domain
`XP_057778314.1`	Pfam	`PF13401`	AAA_22	Domain	198	283	9.8e-08	33.1	AAA domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922331.1
ATGGAAGGAGAAGCTGCTGCAGCCATCCTTCAAGTTCTTGTTCAAAACCTCATCGACCATTCCAAGAAAGAAATCTCACTAATCCGAGGTCTCGACAAAGAAGCAGCAAAGCTTACCGACAGTCTCGACACCATCCAGAAATTCCTCAACGACGCCGAGGCGCGCACCGTCCCCGGCGACGCCGTCAAGAGCTGGCTGAGGCGGCTCGAAGACGCGGCGTTCGACGCCGACAACGTCTTGGATGAGCTCAACTACCATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997052
ATGGAAGGAGAAGCTGCTGCAGCCATCCTTCAAGTTCTTGTTCAAAACCTCATCGACCATTCCAAGAAAGAAATCTCACTAATCCGAGGTCTCGACAAAGAAGCAGCAAAGCTTACCGACAGTCTCGACACCATCCAGAAATTCCTCAACGACGCCGAGGCGCGCACCGTCCCCGGCGACGCCGTCAAGAGCTGGCTGAGGCGGCTCGAAGACGCGGCGTTCGACGCCGACAACGTCTTGGATGAGCTCAACTACCATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778314.1
MEGEAAAAILQVLVQNLIDHSKKEISLIRGLDKEAAKLTDSLDTIQKFLNDAEARTVPGDAVKSWLRRLEDAAFDADNVLDELNYHLLSKQNKPIKPMKAKVLSCFSSSFNSIARPRNMAVRIQEINENLDSLHKEGAGLGLKERLSDEPTLRDAADFETDSFTFIPIFIGRDDVVSEIVEMVTTGMKADERVISIVPIVGMGGLGKTTLTRKVLDHLKTETRVFESHIWVHVSPNFDPTTLFKKILKELTSDQAEVESK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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