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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000295`

染色体: Chr08 坐标: 2034972-2038025 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000295`
名称	SmilChr08G000295
描述	disease resistance protein RPM1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2034972 - 2038025 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999886`
GeneID	`130999886`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999886`
原始查询	`SmilChr08G000295`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RPM1-like
产物	disease resistance protein RPM1-like
Arabidopsis	`AT3G07040` (RPM1) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819889] identity=24.9; qcov=0.766; evalue=3.24e-26; confidence=weak
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=29; qcov=0.883; evalue=1.3e-40; confidence=low
GO	GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999886

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057781559.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057781559.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057781559.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057781559.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781559.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2035299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C56
`Chr8:2035395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B71,C42,C58,C62
`Chr8:2035418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B129,B139,B140,B7
`Chr8:2035489`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	96	A21,A22,A24,A25,A4,A8,B100,B102,B105,B106,B108,B109,B113,B118,B119,B12,B121,B126,B128,B132,B137,B138,B14,B16,B18,B2,B20,B26,B28,B30,B38,B39,B40,B41,B42,B44,B48,B55,B56,B58,B6,B63,B64,B67,B7,B72,B76,B78,B80,B87,B9,B94,B95,B96,B98,C11,C14,C16,C18,C22,C23,C24,C26,C27,C3,C33,C34,C39,C4,C40,C41,C43,C46,C54,C56,C58,C6,C60,C61,C67,C69,C70,C71,C75,C77,C79,C8,C80,C84,C9,D2,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr8:2035491`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A21,B2,B28,B38,B39,B64,B78,B87,B94,B98,C27,C3,C54,C61,C75,C79,C8,D4,D7
`Chr8:2035493`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	75	A22,A24,A25,A4,A8,B100,B102,B105,B106,B108,B109,B110,B113,B118,B119,B12,B121,B126,B128,B132,B137,B138,B14,B16,B18,B20,B26,B30,B40,B41,B42,B48,B55,B56,B58,B6,B63,B67,B7,B72,B76,B9,B94,B95,B96,C11,C14,C16,C18,C22,C23,C24,C26,C33,C34,C39,C4,C40,C41,C43,C46,C58,C60,C67,C69,C70,C71,C77,C80,C84,C9,D5,D6,D8,D9
`Chr8:2035494`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A16,B104,B128,B129,B139,B140,B4,B63,B7
`Chr8:2035496`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B110,B55,B56,C16,C43,C77
`Chr8:2035518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C6
`Chr8:2035554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C66
`Chr8:2035591`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	17	A3,A7,B18,B53,B55,B56,B67,B96,B98,C16,C29,C45,C6,C77,C8,D3,D7
`Chr8:2035602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781559.1

640 aa

320

640

WHD_DRP

LRR_14

PF23559 WHD_DRP 143-207 aa PF23598 LRR_14 291-604 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781559.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	143	207	7.1e-11	42.7	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057781559.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	291	604	4.8e-31	108.5	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925576.1
GAGAGAGAGAGCAGCTTCATAATCTACAGGCAACGAGCAAGGGCGGCGGAGACAAACATGGAATCCTTTGTCGTATTTATGCAGCAATGGTTCGGTGAAGAATTAATTCAACTGACGCAAGGACATGAGGTAGTAAAGTGGATCGAGTACGAATTGGAGACGCTTATACCTCAGTTGGAAATCACCGATTCCGATTCCGACCAAAACGACTTGACAAATATCATCCGCAAAGCGCAGGTCCTCGCCGAGACTTACAACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999886
ATGGAATCCTTTGTCGTATTTATGCAGCAATGGTTCGGTGAAGAATTAATTCAACTGACGCAAGGACATGAGGTAGTAAAGTGGATCGAGTACGAATTGGAGACGCTTATACCTCAGTTGGAAATCACCGATTCCGATTCCGACCAAAACGACTTGACAAATATCATCCGCAAAGCGCAGGTCCTCGCCGAGACTTACAACAAGAGGGTGATGCAGGGAAAGGCTGAAAATTTCAGGAACCCATTCAATATCATCATAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781559.1
MESFVVFMQQWFGEELIQLTQGHEVVKWIEYELETLIPQLEITDSDSDQNDLTNIIRKAQVLAETYNKRVMQGKAENFRNPFNIIIIGTDSRKLHKIRDEITQARQKFLKSAKHARLVSPLSAPENQQRIPFYLRRCIHYFVLFLRDVEVPARRLVALWIAEGFVHSKKHDNESEEHIAQRYLDELINLGIIVIKPNPIGKVKTCAIAAARRDAVLEEATKALQDRDGEIRRQLVVDRNGNDAATALQIDGKPKKKLLSR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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