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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000303`

染色体: Chr08 坐标: 2123221-2126318 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000303`
名称	SmilChr08G000303
描述	uncharacterized CRM domain-containing protein At3g25440, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2123221 - 2126318 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999894`
GeneID	`130999894`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999894`
原始查询	`SmilChr08G000303`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-binding CRS1 / YhbY (CRM) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817396]; symbol=AT2G28480; hit=AT2G28480; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RNA-binding CRS1 / YhbY (CRM) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817396]; symbol=AT2G28480; hit=AT2G28480; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G28480` (AT2G28480) RNA-binding CRS1 / YhbY (CRM) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817396] identity=66.1; qcov=0.832; evalue=2.67e-135; confidence=high
Rice	`Os01g0958400` (OJ1294_F06.29-2) - identity=69.4; qcov=0.682; evalue=1.26e-131; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF01985 (CRS1_YhbY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999894

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057781569.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781569.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781569.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781569.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781569.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2123469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,C37,D7
`Chr8:2123516`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B102,B138,B30,B44,B63,B95,C14,C17,C40
`Chr8:2123556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,B82,C19,C28,C9
`Chr8:2123624`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B102,B138,B30,B63,B95,C14,C17,C4,C40
`Chr8:2123683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B68,B80
`Chr8:2123700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B126,B139,B39,B4,B93,C55,D5
`Chr8:2123702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C14,C17,C4
`Chr8:2123704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,B90,B92,D11
`Chr8:2124193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C6,C8,C85
`Chr8:2124196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,C37,D7
`Chr8:2124211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr8:2124217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781569.1

393 aa

196

393

CRS1_YhbY

PF01985 CRS1_YhbY 172-256 aa

XP_057781570.1

393 aa

196

393

CRS1_YhbY

PF01985 CRS1_YhbY 172-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781569.1`	Pfam	`PF01985`	CRS1_YhbY	Domain	172	256	4.2e-21	75.8	CRS1 / YhbY (CRM) domain
`XP_057781570.1`	Pfam	`PF01985`	CRS1_YhbY	Domain	172	256	4.2e-21	75.8	CRS1 / YhbY (CRM) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925587.1
AATTAATAAATCAGTAAATTTCCTAATAGAATTAATGAATTATACAGTCAAGAGAGATCAGCGATTTGAAATTAGGGCACTCTCTCTGCTCCCTTTTATCTCTACTTCCAAAACTCCGGCCACCGGCGACCTCCGCAACCCCACCCCCACACCGCCAGTCCGCCGCGCTGCCGCGTCACCTCCCAGTGCTCTCACCGCCGCGTTGAGCGCAGCTCCAGGCTCAAATCCCAGAAATTTTGCCGTTTGCATTATGTAGGCAT...

XM_057925586.1
AATTAATAAATCAGTAAATTTCCTAATAGAATTAATGAATTATACAGTCAAGAGAGATCAGCGATTTGAAATTAGGGCACTCTCTCTGCTCCCTTTTATCTCTACTTCCAAAACTCCGGCCACCGGCGACCTCCGCAACCCCACCCCCACACCGCCAGTCCGCCGCGCTGCCGCGTCACCTCCCAGTGCTCTCACCGCCGCGTTGAGCGCAGCTCCAGGCTCAAATCCCAGAAATTTTGCCGTTTGCATTATCTGCAGGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999894
ATGGCGAAACCAGTGCTCCGGTCTCTCCTCAGCGTATCTTCACTTCTCCACCGTTCGATCTCTTTCAGGCAAATCCTTCGGACACGAGAACCCATATTTGCTCTCTTGAGGCCTCCATCTCAACTGCATCAAAGCTCAATTAGTTCCCAACAACCAGTTTGGTGCTGGCAATGGAGAAGCATCACTCATGGGTCAGTAAATGTGGTAATATCACCGCAGGGAAAGCCCATGTTTGAGACCCACGAGATTGATCCCCCGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057781569.1
MAKPVLRSLLSVSSLLHRSISFRQILRTREPIFALLRPPSQLHQSSISSQQPVWCWQWRSITHGSVNVVISPQGKPMFETHEIDPPKKEKWKTKKRLKLQRMKEKQKRKAANKRDPRRLGAKGDKKRKFATAEERIKYKLEQARTKEALLIERLKRYEVPKAQGPMVKPDVLTGEERFYMKKMAQKRSNYVEVGRRGVYGGVILNMHMHWKKHETVEVICKPCKPGEVHEYADEIARLSGGIPIQVIGDNTIIFYRGKNY...

XP_057781570.1
MAKPVLRSLLSVSSLLHRSISFRQILRTREPIFALLRPPSQLHQSSISSQQPVWCWQWRSITHGSVNVVISPQGKPMFETHEIDPPKKEKWKTKKRLKLQRMKEKQKRKAANKRDPRRLGAKGDKKRKFATAEERIKYKLEQARTKEALLIERLKRYEVPKAQGPMVKPDVLTGEERFYMKKMAQKRSNYVEVGRRGVYGGVILNMHMHWKKHETVEVICKPCKPGEVHEYADEIARLSGGIPIQVIGDNTIIFYRGKNY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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