当前解析结果
SmilChr08G000305| 统一新 Gene ID | SmilChr08G000305 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000305 |
| 描述 | histone chaperone ASF1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 2128346 - 2128750 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130997053 |
|---|---|
| GeneID | 130997053 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997053 |
| 原始查询 | SmilChr08G000305 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | histone chaperone ASF1-like |
| 产物 | histone chaperone ASF1-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997053 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057778315.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057778315.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057778315.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057778315.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057778315.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:2128349 |
CCT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 13 | A14,B110,B114,B3,B50,B58,B66,B8,B95,B97,C19,C3,C72 |
Chr8:2128375 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 13 | A14,B110,B114,B3,B50,B58,B66,B8,B95,B97,C19,C3,C72 |
Chr8:2128379 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 30 | A5,A7,B106,B111,B112,B122,B130,B139,B140,B38,B39,B47,B57,B74,B8,B91,C10,C12,C15,C21,C31,C35,C37,C43,C61,C67,C71,C72,C77,D10 |
Chr8:2128382 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 29 | A5,A7,B106,B111,B112,B122,B130,B139,B140,B38,B39,B47,B57,B8,B91,C10,C12,C15,C21,C31,C35,C37,C43,C61,C67,C71,C72,C77,D10 |
Chr8:2128393 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 25 | A5,B106,B111,B122,B130,B140,B38,B39,B47,B57,B91,C10,C12,C15,C21,C31,C35,C37,C43,C61,C67,C71,C72,C77,D10 |
Chr8:2128394 |
C |
CTA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 25 | A5,B106,B111,B122,B130,B140,B38,B39,B47,B57,B91,C10,C12,C15,C21,C31,C35,C37,C43,C61,C67,C71,C72,C77,D10 |
Chr8:2128409 |
T |
TTC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 10 | A11,B135,B15,B20,B24,B56,C39,C41,C45,C86 |
Chr8:2128410 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C85 |
Chr8:2128416 |
T |
TGC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 16 | A11,B108,B115,B122,B135,B15,B20,B24,B31,B56,C36,C39,C41,C45,C85,C86 |
Chr8:2128417 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 17 | A11,B108,B115,B122,B135,B15,B20,B24,B31,B56,B97,C36,C39,C41,C45,C85,C86 |
Chr8:2128447 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C14 |
Chr8:2128456 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 24 | A14,B106,B110,B114,B138,B14,B25,B3,B38,B50,B57,B58,B66,B8,B95,B97,C15,C19,C3,C31,C72,C77,D3,D7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。