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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000322`

染色体: Chr08 坐标: 2244535-2246721 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000322`
名称	SmilChr08G000322
描述	kirola-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2244535 - 2246721 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997056`
GeneID	`130997056`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997056`
原始查询	`SmilChr08G000322`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	kirola-like
产物	kirola-like
Arabidopsis	`AT1G70830` (MLP28) MLP-like protein 28 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843420] identity=40.8; qcov=0.899; evalue=4.38e-40; confidence=medium
Rice	`Os04g0465600` - identity=23.9; qcov=0.917; evalue=6.83e-11; confidence=weak
GO	GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00407 (Bet_v_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997056

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778318.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778318.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778318.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778318.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778318.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2244935`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C24
`Chr8:2244935`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C24
`Chr8:2244966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr8:2245054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B15,B40,C1,C75
`Chr8:2246041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B73,C3
`Chr8:2246043`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B127,B13,C32,C45,C68,C78
`Chr8:2246105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	A10,A2,A7,B105,B13,B18,B20,B25,B3,B36,B52,B56,B61,B64,B66,B90,B92,B93,B96,C33,C52,C53,C65,C85,C86,C87
`Chr8:2246107`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B30,C8,C85
`Chr8:2246107`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B30,C8,C85
`Chr8:2246163`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B44,B73,C3
`Chr8:2246163`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B44,B73,C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778318.1

169 aa

169

Bet_v_1

PF00407 Bet_v_1 21-167 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778318.1`	Pfam	`PF00407`	Bet_v_1	Domain	21	167	2.6e-37	128.8	Pathogenesis-related protein Bet v 1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922335.1
ATGATACACCATATCTGGTACACTGGATCTCAAGTGCAGGGAAATTTGGAGATCGGTTTACATGGTAAATTGATTGCAGCAATAGAATTCAAAGCTGGTAGAGATGTGTTCTACAATCTTCTCAAAAACAATCCACAAGATTTTTCCACAATTATCCCTGAAAAAGTACAAGGTTGTGATCTTCATGAGGGTGAATTTGGTCGTGTTGGTTCCATCATTTGCTGGAGGTACACCCATGATGGGAAACAGAAGAAAGCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997056
ATGATACACCATATCTGGTACACTGGATCTCAAGTGCAGGGAAATTTGGAGATCGGTTTACATGGTAAATTGATTGCAGCAATAGAATTCAAAGCTGGTAGAGATGTGTTCTACAATCTTCTCAAAAACAATCCACAAGATTTTTCCACAATTATCCCTGAAAAAGTACAAGGTTGTGATCTTCATGAGGGTGAATTTGGTCGTGTTGGTTCCATCATTTGCTGGAGGTACACCCATGATGGGAAACAGAAGAAAGCGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778318.1
MIHHIWYTGSQVQGNLEIGLHGKLIAAIEFKAGRDVFYNLLKNNPQDFSTIIPEKVQGCDLHEGEFGRVGSIICWRYTHDGKQKKAKEVIQSIDEEKKLIELKIIEGDMMELYKAFVVAVHVETTGDIDLLTWTLKYEMLNEDVEHPISFLSYVIDITKEVEAHHLAKP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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