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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000325`

染色体: Chr08 坐标: 2274100-2276140 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000325`
名称	SmilChr08G000325
描述	kirola-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2274100 - 2276140 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999915`
GeneID	`130999915`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999915`
原始查询	`SmilChr08G000325`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	kirola-like
产物	kirola-like
Arabidopsis	`AT1G70830` (MLP28) MLP-like protein 28 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843420] identity=48; qcov=0.974; evalue=5.23e-45; confidence=medium
Rice	`Os04g0465600` - identity=21.3; qcov=0.895; evalue=3.14e-06; confidence=weak
GO	GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00407 (Bet_v_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999915

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781594.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057781594.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781594.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781594.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781594.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2274367`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A14
`Chr8:2274367`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A14
`Chr8:2274549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr8:2274598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B68,B80,D10
`Chr8:2274620`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A13,A19,B108,B120,B136,B19,B21,B28,B45,B75,C12,C38,C41,C64,C66,C72
`Chr8:2275858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C81
`Chr8:2275863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr8:2275875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr8:2275895`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:2275927`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B126,B136,B3
`Chr8:2275927`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B126,B136,B3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781594.1

152 aa

152

Bet_v_1

PF00407 Bet_v_1 4-147 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781594.1`	Pfam	`PF00407`	Bet_v_1	Domain	4	147	6.6e-39	133.9	Pathogenesis-related protein Bet v 1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925611.1
GAAAAAGCAAAGACTAAAAAATTTTGAAGTGGCCATATCATGAATCATGATGCCGGAGCTTGGCCTATATAAAGAGAAGATTGCATTCAATTCTATGCATCCCATCTCTTTACTCACAAGTATATATATACATATTCATTTCAATAAGTTAATTAGAGCAATTTTGAGATGGGGTTACATGGGAAATTGGTTTCAGCAATAGAATTCAAAGCTGGTGGAGATGTGTTTCATGAACTATTTAGGCACAAACCACATGATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999915
ATGGGGTTACATGGGAAATTGGTTTCAGCAATAGAATTCAAAGCTGGTGGAGATGTGTTTCATGAACTATTTAGGCACAAACCACATGATATCTCCACAATGAGCCCTGGTATAGTACAAGGTTGTGATCTTCATGAGGGTGAATTTGGTCACGTTGGTTCTATCATTTGCTGGACTTACACCCATGATGGGAAAGAGAAGAAGGCAAAAGAGGTGATCCAAGCCATTGATGAGGAGAAAAAATTGATCCAATTTAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781594.1
MGLHGKLVSAIEFKAGGDVFHELFRHKPHDISTMSPGIVQGCDLHEGEFGHVGSIICWTYTHDGKEKKAKEVIQAIDEEKKLIQFKMIEGDVMELYKDFVITIHVETNGGIDLVTCTFEYEMLNEDVEHPISLLTLFIDLTKDIETHHASKT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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