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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000332`

染色体: Chr08 坐标: 2325583-2327651 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000332`
名称	SmilChr08G000332
描述	uncharacterized SmilChr08G000332
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2325583 - 2327651 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999921`
GeneID	`130999921`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999921`
原始查询	`SmilChr08G000332`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834358]; symbol=AT5G43400; hit=AT5G43400; species=arabidopsis; confidence=high
产物	plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834358]; symbol=AT5G43400; hit=AT5G43400; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G43400` (AT5G43400) plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834358] identity=59.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0652100` - identity=52.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF11443 (DUF2828); PF25043 (DUF7788)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999921

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057781601.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057781601.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057781601.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781601.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781601.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2325771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B97,C82
`Chr8:2325793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,C49,C78
`Chr8:2325803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B129,B15
`Chr8:2325858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B2
`Chr8:2325858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:2325864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,C20
`Chr8:2325953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,B63
`Chr8:2325980`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr8:2325980`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr8:2325986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr8:2326022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C31
`Chr8:2326032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B36,B98,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781601.1

593 aa

296

593

DUF2828

DUF7788

PF11443 DUF2828 25-391 aa PF25043 DUF7788 393-573 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781601.1`	Pfam	`PF11443`	DUF2828	Repeat	25	391	3.3e-132	441.9	Domain of unknown function (DUF2828)
`XP_057781601.1`	Pfam	`PF25043`	DUF7788	Domain	393	573	5.8e-80	268.4	Domain of unknown function (DUF7788)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925618.1
CTCCAAGTATTTCATCCCTATAATAACTTCTCCATTACAAATTTACAATCCAACCAAAAACCCTAATTTCCACACAACAAGCAATCAATCAATCAAAAACCTTCGCTCCTCTCAGAATCATGGCCGCCGGCGCCGATCTCGTTGGACCACCGGAAATCTACCAACAACCGAAGCGGCAGAAGCTCGGCCTGACGGAGAACAATTCCCCAACGTTTCTCTCGACGGGGAACCCTTGTCTGGATTTCTTCTTCCACATCGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999921
ATGGCCGCCGGCGCCGATCTCGTTGGACCACCGGAAATCTACCAACAACCGAAGCGGCAGAAGCTCGGCCTGACGGAGAACAATTCCCCAACGTTTCTCTCGACGGGGAACCCTTGTCTGGATTTCTTCTTCCACATCGTCCCCGACACGCCGCCGCAGGCCGTCGCCGACCGCCTGCAACTCGCGTGGCGCCACGATCCGCTCACGGCGCTCAAGCTCGTGTGCAACCTCCGCGGCGTCAAAGGCACCGGCAAATCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781601.1
MAAGADLVGPPEIYQQPKRQKLGLTENNSPTFLSTGNPCLDFFFHIVPDTPPQAVADRLQLAWRHDPLTALKLVCNLRGVKGTGKSDREGFYAAALWLHQHHPKTLAGNVAAFAGFGYFKDLLEILFRILDGSEARKSAKRIGMKWKSWRNLGGRRKRMDFRRHFGDEAFSDQLKTREEKRIERARKVVDRFNEDSDFKFFHENVSDLFAQRLRSDMEMLKSENLNKISLAAKWCPSLDSSFDRITLLCETIGKKVFPRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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