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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000333`

染色体: Chr08 坐标: 2328319-2330145 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000333`
名称	SmilChr08G000333
描述	uncharacterized SmilChr08G000333
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2328319 - 2330145 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999922`
GeneID	`130999922`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999922`
原始查询	`SmilChr08G000333`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826976]; symbol=AT4G13440; hit=AT4G13440; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826976]; symbol=AT4G13440; hit=AT4G13440; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G13440` (AT4G13440) Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826976] identity=34.4; qcov=0.734; evalue=3.68e-25; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF13499 (EF-hand_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999922

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057781602.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057781602.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057781602.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057781602.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781602.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2328417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B97,C79,C82
`Chr8:2328438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B83,C25
`Chr8:2328503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:2329523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:2329540`	`C`	`CT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	B18
`Chr8:2329540`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B18
`Chr8:2329545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr8:2329704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B27,C72
`Chr8:2329812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C58
`Chr8:2329817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,C72,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781602.1

214 aa

107

214

EF-hand_7

PF13499 EF-hand_7 23-79 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781602.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	23	79	2.9e-10	41.1	EF-hand domain pair

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925619.1
AATTCATACCTTTTTTTATATATCAAAACATATTAACGGGACAAAAAATGGGACACCCTAAAAATGCGTGCACACATCAAGCCAAAAACAAGACTGCTCCCTATAATGACTTTTGAAAAAGACTAATCTCCAAATTAATCATACATACCCTACATATACACAAAAAATAATTTAATTATTTTAATTAGAACACACAAATTAATATATATACCATTCATTCACCAATACTTCCTAAGTGACTAAGAGAGTGTATAGGGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999922
ATGAATGAGATAAGAGAAGTTGCAAAGGCCTACTACCATGGGAGGGGAGAACAAGAGAAAGAGCTGGCGCGACAGTTCTTCAAATCCCTGGATGCAGACAACAACAACGTTGTCTGCCTCCAGGAGTACAAGAAGTACGTGAAATCCTCTCTCTCGAGTGATGACGAGGTTTTCAAGCTATTGGACAAGAACGGGGACAAAACCCTAGACTTCAACGAAGTGTTGGCCCTTTATTACATGGATAAAGTCTCCATTCCTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781602.1
MNEIREVAKAYYHGRGEQEKELARQFFKSLDADNNNVVCLQEYKKYVKSSLSSDDEVFKLLDKNGDKTLDFNEVLALYYMDKVSIPRCKVCDKLLLASYFSCLRCLGKPSYNVCCDCYGGGRYEHHHASSEFRDTRALLTMLDRIMDPKACEEDPNNCEKNDADQENGAKRSTSRSKSERILETLEALNAGFLLGGTVVTAVGAVAVAPACIIM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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