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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000337`

染色体: Chr08 坐标: 2354877-2357832 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000337`
名称	SmilChr08G000337
描述	uncharacterized SmilChr08G000337
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2354877 - 2357832 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999930`
GeneID	`130999930`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999930`
原始查询	`SmilChr08G000337`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824911]; symbol=AT3G57440; hit=AT3G57440; species=arabidopsis; confidence=low
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824911]; symbol=AT3G57440; hit=AT3G57440; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G57440` (AT3G57440) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824911] identity=35.2; qcov=1.09; evalue=1.32e-19; confidence=low
Rice	`Os07g0656300` - identity=43.9; qcov=0.291; evalue=2.37e-10; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25370 (HTH_74)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999930

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781619.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781619.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781619.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781619.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057781619.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2355002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,C8
`Chr8:2355156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr8:2355180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr8:2355208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B44,B97
`Chr8:2355218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B82,C54
`Chr8:2355226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C58
`Chr8:2355261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr8:2355282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,C80,D2
`Chr8:2355311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,A3
`Chr8:2356504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B98,C27,C7
`Chr8:2356519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,D11
`Chr8:2356526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781619.1

227 aa

114

227

HTH_74

PF25370 HTH_74 163-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781619.1`	Pfam	`PF25370`	HTH_74	Domain	163	203	1.8e-21	76.5	HTH three-helical bundle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925636.1
TCAAAACGGTCCCGCCATTTTCAAAATACGAAAAAGCAAAAACCAAAAAATGGTGTCCAAAACTGTGGAAGTTTCATTTCCTTCAAACATCGAACGCAGCGTCGCATCCGCGCTTCTCAGTCTCTCCTCCTGTCCTTCCGTGGGAATGAGCGGCGGCGACGGTGACAGTCCAGAGAGCCTCGAGAGCACGGCGATTTCCGCCCTCAGAAGCGGCGGATCGCCGGCCGAGGTGGAGGCGAGTGTGGATGATGAATCGTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999930
ATGGTGTCCAAAACTGTGGAAGTTTCATTTCCTTCAAACATCGAACGCAGCGTCGCATCCGCGCTTCTCAGTCTCTCCTCCTGTCCTTCCGTGGGAATGAGCGGCGGCGACGGTGACAGTCCAGAGAGCCTCGAGAGCACGGCGATTTCCGCCCTCAGAAGCGGCGGATCGCCGGCCGAGGTGGAGGCGAGTGTGGATGATGAATCGTCGAGCGCTCAGCAGCTGATGGCGGCGGCGTTTGTGTCCGGATCGCATGATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781619.1
MVSKTVEVSFPSNIERSVASALLSLSSCPSVGMSGGDGDSPESLESTAISALRSGGSPAEVEASVDDESSSAQQLMAAAFVSGSHDLKLKIVQKKRSKSIYISNGKKPKTSSKPVATPAFSASSETFSEITTEASSCLSSNSSGQSLGSKTSAADKGRKPVIPSHMSHKAAAIMRFLADGSASEVMIRQLLGDSPSTSKALRMLLKLQAVKRFGAGGRSDPYIYMIA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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