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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000339`

染色体: Chr08 坐标: 2361486-2366407 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000339`
名称	SmilChr08G000339
描述	2-isopropylmalate synthase A-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2361486 - 2366407 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999927`
GeneID	`130999927`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999927`
原始查询	`SmilChr08G000339`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	2-isopropylmalate synthase A-like
产物	2-isopropylmalate synthase A-like
Arabidopsis	`AT1G74040` (IMS1) 2-isopropylmalate synthase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843742] identity=78; qcov=0.904; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0138900` (OsIPMS2) - identity=73.4; qcov=0.945; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003852 (2-isopropylmalate synthase activity); GO:0009098 (L-leucine biosynthetic process); GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	smil00290 (Valine, leucine and isoleucine biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00620 (Pyruvate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01210 (2-Oxocarboxylic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00682 (HMGL-like); PF08502 (LeuA_dimer); PF22617 (HCS_D2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999927

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057781611.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057781611.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781611.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781611.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781611.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2361671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B37,B75,C27,C57
`Chr8:2361691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C52
`Chr8:2361708`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B25
`Chr8:2361708`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B25
`Chr8:2361711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr8:2361723`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B45
`Chr8:2361723`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B45
`Chr8:2361781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C37
`Chr8:2361883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr8:2361952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr8:2362030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B32,B44,C51
`Chr8:2362042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B30,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781611.1

604 aa

302

604

HMGL-like

HCS_D2

LeuA_dimer

PF00682 HMGL-like 62-340 aa PF22617 HCS_D2 354-438 aa PF08502 LeuA_dimer 440-584 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781611.1`	Pfam	`PF00682`	HMGL-like	Domain	62	340	1.2e-91	307.5	HMGL-like
`XP_057781611.1`	Pfam	`PF22617`	HCS_D2	Domain	354	438	4.1e-28	98.3	Homocitrate synthase post-HMGL domain-like
`XP_057781611.1`	Pfam	`PF08502`	LeuA_dimer	Domain	440	584	1.1e-30	106.9	LeuA allosteric (dimerisation) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925628.1
AAATATTAGGGTTTTTTAACTGACATTAATCTCTCTCTAAATAAATCCTATCCTTCACTTCTCCTCCCAAATTCAATTCAACAATGGCGTCTTCGATTTGCAAGCACGCAGCCATCCCGCCACCTCCCACCACCTTCCGCTCCACAAAAATCCCCATCCGCCCGCTCTACCTCATCAGAAATGGCCGTCCATCCTCCGCCGCCGCCGTCCGCTGCTCCCTCCTCCGCCCGGATTACATCCCCAACCGCATACCGGACCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999927
ATGGCGTCTTCGATTTGCAAGCACGCAGCCATCCCGCCACCTCCCACCACCTTCCGCTCCACAAAAATCCCCATCCGCCCGCTCTACCTCATCAGAAATGGCCGTCCATCCTCCGCCGCCGCCGTCCGCTGCTCCCTCCTCCGCCCGGATTACATCCCCAACCGCATACCGGACCCCAAGTACGTGCGCATCTTCGACACCACCCTCCGCGACGGCGAGCAGTCCCCCGGCGCCACCATGACCACCAAGGAGAAGCTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781611.1
MASSICKHAAIPPPPTTFRSTKIPIRPLYLIRNGRPSSAAAVRCSLLRPDYIPNRIPDPKYVRIFDTTLRDGEQSPGATMTTKEKLDIARQLARLGVDIIEAGFPASSEADFEAVELIAREFGNAVDSDHVPVICGLARCNKRDIERSWDAVKHAKKPRIHTFIATSEIHMKFKLKMTPEQVVEKARSMVAYARSLGCEDVEFSPEDAGRSDREFLYQILGEVIKAGATTLNIPDTVGYTLPSEFGQLIADIKANTPGIE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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