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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000340`

染色体: Chr08 坐标: 2367078-2370386 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000340`
名称	SmilChr08G000340
描述	uncharacterized SmilChr08G000340
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2367078 - 2370386 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999928`
GeneID	`130999928`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999928`
原始查询	`SmilChr08G000340`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	spliceosome protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841879]; symbol=AT1G54380; hit=AT1G54380; species=arabidopsis; confidence=low
产物	spliceosome protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841879]; symbol=AT1G54380; hit=AT1G54380; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G54380` (AT1G54380) spliceosome protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841879] identity=34.7; qcov=0.833; evalue=2.12e-66; confidence=low
Rice	`Os11g0293300` - identity=45.3; qcov=0.467; evalue=1.05e-64; confidence=medium
GO	GO:0000387 (spliceosomal snRNP assembly); GO:0005634 (nucleus); GO:0032797 (SMN complex)
KEGG	-
Pfam	PF04938 (SIP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999928

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781612.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057781612.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057781612.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781612.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781612.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2367245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,C24
`Chr8:2367253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr8:2367259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,D11
`Chr8:2367266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr8:2367281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B5,B71,C58
`Chr8:2367293`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	B113,B124,B69,B95,C36,C50,C63,C67,C75,C84
`Chr8:2367364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:2367428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,C24
`Chr8:2367458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B32,B44,B9,C51
`Chr8:2367471`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	52	A13,A14,A19,A23,B101,B107,B108,B109,B119,B120,B130,B134,B136,B21,B29,B35,B37,B40,B42,B43,B47,B5,B53,B59,B61,B62,B63,B71,B73,B75,B89,B91,B95,C12,C14,C15,C19,C23,C28,C30,C36,C38,C40,C41,C58,C7,C72,C76,C77,C78,C79,C9
`Chr8:2367497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:2367539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781612.1

544 aa

272

544

SIP1

PF04938 SIP1 304-540 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781612.1`	Pfam	`PF04938`	SIP1	Family	304	540	6e-45	154.4	Survival motor neuron (SMN) interacting protein 1 (SIP1)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925629.1
GTTAAAAAATTGAAATTGGACCGAAATTTTTGGGAGGAGGTGTTCCAATTCACTATATATACGGATTTGGTATTGCCTAAATTCTTTCAAATTAACAGCTCAATTATTTTCCGATGTTAGCACAATCTTCTCTCATAGATTCGGACGGCCGCGAAGCCGCCGCAGTTCACCGGAGCTTCGTCGATACTCCGGCGGAAGCGCCGCCTCACGGTCTCATTAATCTACAATCTTCCAACGGCTCAGGCAATTTCACTGCGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999928
ATGTTAGCACAATCTTCTCTCATAGATTCGGACGGCCGCGAAGCCGCCGCAGTTCACCGGAGCTTCGTCGATACTCCGGCGGAAGCGCCGCCTCACGGTCTCATTAATCTACAATCTTCCAACGGCTCAGGCAATTTCACTGCGGAAGCCGCAAGAGACGCTTCCGATAATTCCACAAACAGCAGCGCCTCTGTTCCTGTTGAAGAAAGCATCCGCGACGGCGTCGTTCAGGAGTCCGATGCATATGAAGCCGTCTTATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781612.1
MLAQSSLIDSDGREAAAVHRSFVDTPAEAPPHGLINLQSSNGSGNFTAEAARDASDNSTNSSASVPVEESIRDGVVQESDAYEAVLSNDAEIGVQRIEEKNDEEVQINCSKKCASEVQVFEYTEFINHDESGSKRNWKQQEPKEKRPKRRGGRGRRNNEGLNCYPSERREKKGLMYSREEMEALRFEELEDQKKKWIEIYCRLGATVVDEYDGLVRLDRAREKDSVPSFDFDPRPQFQKCANLGEVCPKVEGDHLENLNA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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