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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000343`

染色体: Chr08 坐标: 2385833-2387436 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000343`
名称	SmilChr08G000343
描述	protein ENHANCED PSEUDOMONAS SUSCEPTIBILITY 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2385833 - 2387436 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999933`
GeneID	`130999933`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999933`
原始查询	`SmilChr08G000343`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ENHANCED PSEUDOMONAS SUSCEPTIBILITY 1-like
产物	protein ENHANCED PSEUDOMONAS SUSCEPTIBILITY 1-like
Arabidopsis	`AT5G67160` (EPS1) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836851] identity=38; qcov=1.03; evalue=7.35e-89; confidence=medium
Rice	`Os08g0111800` - identity=37; qcov=0.967; evalue=1.6e-78; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999933

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781622.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057781622.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781622.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781622.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781622.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2385986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,B83,C70,C78
`Chr8:2386068`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	186	A1,A10,A11,A13,A14,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A4,A5,A7,A8,A9,B10,B100,B101,B103,B104,B107,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B120,B124,B126,B127,B128,B13,B130,B134,B135,B137,B138,B14,B140,B16,B17,B18,B2,B21,B22,B23,B24,B28,B29,B3,B30,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B42,B46,B47,B48,B5,B50,B52,B53,B54,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B69,B7,B70,B73,B74,B75,B77,B78,B8,B80,B81,B82,B84,B85,B89,B9,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C14,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C35,C37,C38,C4,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C67,C68,C69,C7,C74,C76,C78,C79,C8,C80,C81,C83,C84,C85,C87,D1,D10,D11,D2,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr8:2386071`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	20	A23,B102,B11,B122,B123,B131,B27,B31,B84,B86,C13,C37,C41,C53,C58,C73,C76,D11,D2,D5
`Chr8:2386072`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	114	A1,A11,A18,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A4,A7,A9,B10,B103,B107,B109,B11,B112,B114,B124,B128,B130,B137,B138,B14,B140,B16,B17,B2,B21,B22,B24,B3,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B42,B47,B48,B5,B54,B56,B58,B59,B6,B60,B62,B64,B65,B67,B69,B7,B73,B77,B78,B8,B85,B89,B94,B95,B97,B98,B99,C10,C11,C14,C16,C17,C18,C2,C21,C22,C24,C25,C26,C28,C3,C31,C32,C35,C37,C42,C43,C44,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C55,C57,C59,C6,C62,C63,C64,C65,C7,C74,C78,C79,C80,C81,D11,D2,D4,D6,D7,D8,D9
`Chr8:2386082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr8:2386093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B59
`Chr8:2386093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr8:2386114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B53,C2,C42
`Chr8:2386151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr8:2386158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B55,B90,B96,C45,C85
`Chr8:2386193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr8:2386196`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A16,B107,B122,B134,B139,B18,B6,B63,C43,C64,C79,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781622.1

427 aa

214

427

Transferase

PF02458 Transferase 4-423 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781622.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	4	423	7.7e-79	266.1	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925639.1
CAACATGAGTGGCATACGTAGCTGGTCTGATTTGCAAAGTCAACAATGACGGCGGCTTTGGACCACTCCTTGTGAATCAAGTAATTTGCTTCTCACTCAAGAAAATATTTATTTATTTAATCTTGTATTCTACATAGATTCTTTTCTCTCACACCCAAAATTAGAATTTGAAGATGGCAAAAAAAGTCGAGCTGATTTCTTCATCTCTTGTTAGCGCCACTGCAACTGCTGCTTCAACTTCAATCTCAAGATTAGAGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999933
ATGGCAAAAAAAGTCGAGCTGATTTCTTCATCTCTTGTTAGCGCCACTGCAACTGCTGCTTCAACTTCAATCTCAAGATTAGAGCTTAATCCATGGGATTTACGATTACTCCCAATCGTTCCCATCCAAAGAGGCCTCATATTCCACACCTCTCACTTCCAATCCCAACAACACCTAATCCAACACCTCAAAAACTCCCTCTCCCGCGCTCTCGACTTTTTCCCTCCCCTCGCCGGCCGCCTCGCCGCCACGCCGCACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781622.1
MAKKVELISSSLVSATATAASTSISRLELNPWDLRLLPIVPIQRGLIFHTSHFQSQQHLIQHLKNSLSRALDFFPPLAGRLAATPHDGDTASFFVDCNNAGAEFTHAVAAAVSVSDIVEPSYIPEIVSSLIPISVGVTNYEGISKPLLAVQVTELADGLFIGCAANHAVVDGTSFWHFLNSWSEISRGSELISRSPIFDRCNVAAVDNRLIHIPTLEKNLIAPCQLPQKVFHFSKEKLGQLKAKANSEAGTDKISTLQAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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