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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000349`

染色体: Chr08 坐标: 2413039-2414603 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000349`
名称	SmilChr08G000349
描述	uncharacterized acetyltransferase At3g50280-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2413039 - 2414603 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999939`
GeneID	`130999939`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999939`
原始查询	`SmilChr08G000349`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836850]; symbol=AT5G67150; hit=AT5G67150; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836850]; symbol=AT5G67150; hit=AT5G67150; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G67150` (AT5G67150) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836850] identity=39.5; qcov=1.05; evalue=1.47e-87; confidence=medium
Rice	`Os08g0111800` - identity=36.9; qcov=1.01; evalue=2.72e-74; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999939

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781627.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057781627.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781627.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781627.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781627.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2413216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr8:2413217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B24,C38
`Chr8:2413291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D5
`Chr8:2413311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C51
`Chr8:2413352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B139,B14,B28
`Chr8:2413357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr8:2413363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B139,B28
`Chr8:2413384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B35,C28,C37,C67
`Chr8:2413399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B95
`Chr8:2413459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr8:2413489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B89,C48
`Chr8:2413503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781627.1

428 aa

214

428

Transferase

PF02458 Transferase 4-423 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781627.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	4	423	3.4e-76	257.4	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925644.1
AAGGTGATATTTTTCATAAAACAACCATTATAGTCAACTATGAAAAAAAAACACGAAATAGACAGCTTATATATAAAAACCAATTCGCAGAAATTGGTTGGCTTCTCAGGAAGTTTCTGTATTTAAACTTCCATTCTACCAAGTTAATTATTTTCTCTCACACCCAAAATTAGGATTTGAAAATGGCAAAAAAAGTTGAGCTGATTTCTTCATCTCTTGTAAGCGGCACTGCAGCTGCTTCAATGTCAAGATTAGAGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999939
ATGGCAAAAAAAGTTGAGCTGATTTCTTCATCTCTTGTAAGCGGCACTGCAGCTGCTTCAATGTCAAGATTAGAGCTTAATTCATGGGATTTGCGTTTATTCCATATCTTCCCCATTGAAAGAGGCCTCATATTCCACATCCCTCACATTCAATCCCAACAACACCTAATCCAACACCTCAAAAACTCACTCTCCCGCGCTCTCGACTTTTTCCCTCCCCTCGCCGGCCGCCTCGCCGCCACGCCGCACGACGGCGACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781627.1
MAKKVELISSSLVSGTAAASMSRLELNSWDLRLFHIFPIERGLIFHIPHIQSQQHLIQHLKNSLSRALDFFPPLAGRLAATPHDGDTACFFVDCNNAGGEFTHAVAAAVSISDIIEPRCIPEIVSSLIPINVGVTNYDGISKPLLAVQVTELTDGLFIGCAANHAVVDGTSFWHFLNSWSEISRGSESISRSPIFDRCNAAAVDNRLIHIPTLEKNLIAPSQLLPQKVFHFSKEKLGELKAKANSEAGTDKISTLQALMA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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