Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000366`

染色体: Chr08 坐标: 2518467-2520502 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000366`
名称	SmilChr08G000366
描述	exocyst complex component EXO70H1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2518467 - 2520502 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999959`
GeneID	`130999959`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999959`
原始查询	`SmilChr08G000366`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	exocyst complex component EXO70H1
产物	exocyst complex component EXO70H1
Arabidopsis	`AT5G59730` (EXO70H7) exocyst subunit exo70 family protein H7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836094] identity=39.4; qcov=1.07; evalue=5.73e-141; confidence=medium
Rice	`Os04g0382200` (EXO70F3) - identity=31.9; qcov=0.785; evalue=1.47e-75; confidence=low
GO	GO:0000145 (exocyst); GO:0005546 (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding); GO:0006887 (exocytosis)
KEGG	-
Pfam	PF03081 (Exo70_C); PF20669 (Exo70_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999959

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057781654.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057781654.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057781654.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781654.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781654.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2518749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,A19,B114,C41,C54
`Chr8:2518759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr8:2518772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:2518885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr8:2518906`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C37
`Chr8:2518906`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C37
`Chr8:2518909`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C37
`Chr8:2518909`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C37
`Chr8:2518910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,B84,C67
`Chr8:2518918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr8:2518982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr8:2519012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B135,B21,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781654.1

559 aa

280

559

Exo70_N

Exo70_C

PF20669 Exo70_N 48-128 aa PF03081 Exo70_C 221-555 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781654.1`	Pfam	`PF20669`	Exo70_N	Repeat	48	128	2.9e-08	34.6	Exocyst complex component Exo70 N-terminal
`XP_057781654.1`	Pfam	`PF03081`	Exo70_C	Repeat	221	555	9e-95	318.6	Exo70 exocyst complex subunit C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925671.1
TACACATTCGAAATTTCAAATTCTCACTCTCACTCCCATCTATTGATTCTATTTATACGCATTGATTTTCTCACTCCAAAATCCAAACCAAAATCACAAATTCTATAACTGCAAAAGTTGAGCAAAATGAAAAAGAAAATCCATCACGCAGCCAACAAATTTCAAATCCACAAACACTGAAATCAAGTTATTGTGAGGAAAATGAAAATTCGGATATTTTCTAGTAACGTAAGTGATCATTCTTCTCTACAGTCTCATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999959
ATGAAAATTCGGATATTTTCTAGTAACGTAAGTGATCATTCTTCTCTACAGTCTCATCATCATCACCGCAACTCCGCCGCTCCGTCGTCGGCGACGCCTCGCCCCCGCAGCCTCTCCGAGATCATGGCGGAGGAATGCATCAGCTGCGCCAGTTATTTAATCAGGAAATGGCAAGTAGATGCCGGCAAATTCGGAACACTCTCATCTCTGTTTCTCTCTGACAGAGAAGAAGCTGAGAAATTGCTGGAAGCTACGATCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781654.1
MKIRIFSSNVSDHSSLQSHHHHRNSAAPSSATPRPRSLSEIMAEECISCASYLIRKWQVDAGKFGTLSSLFLSDREEAEKLLEATIGLQRAMKYHVKLSTTSDELVGAQALMQIAMQRLKFEFYAILSANRNDCVSENRESAAAAAAAPRPASESERAVEDLKSVAECMIACGYGKECVNIYRIVRKSIVDEAIYCLGIERLSSAQLKKMEWTALETRIQRWLSAVNIVVRKLFYREKVICDAVFSSSKKIAEACFAAVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器