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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000384`

染色体: Chr08 坐标: 2698612-2700348 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000384`
名称	SmilChr08G000384
描述	uncharacterized protein At1g24485-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2698612 - 2700348 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999975`
GeneID	`130999975`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999975`
原始查询	`SmilChr08G000384`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	kinase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823773]; symbol=AT3G46280; hit=AT3G46280; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	kinase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823773]; symbol=AT3G46280; hit=AT3G46280; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G46280` (AT3G46280) kinase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823773] identity=36; qcov=0.955; evalue=4.49e-32; confidence=medium
Rice	`Os12g0102500` - identity=35; qcov=0.71; evalue=1.18e-21; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12819 (Malectin_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999975

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057781671.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057781671.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781671.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781671.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781671.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2698667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C48
`Chr8:2698688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B3,B56,B96,C86
`Chr8:2698715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A11,A18,A23,A24,A3,B109,B112,B129,B130,B19,B34,B79,B81,B95,B98,C14,C15,C31,C39,C40,C43,C73,C77,C84,D6
`Chr8:2698726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:2699523`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	C28,C31,C78,C79,C80
`Chr8:2699523`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	C28,C31,C78,C79,C80
`Chr8:2699532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr8:2699534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C3
`Chr8:2699559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C25
`Chr8:2699562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B113,B3,B56,B96
`Chr8:2699565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C50
`Chr8:2699590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781671.1

221 aa

110

221

Malectin_like

PF12819 Malectin_like 27-193 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781671.1`	Pfam	`PF12819`	Malectin_like	Domain	27	193	4.4e-46	158.4	Malectin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925688.1
AGTCTTATTTTCGTTTGTCCACAAAAATTGTATGTTTTCCTTTTTTGTGAAAAACTCTCCAATTCTGGTTGTCTTTTTCAATGAAAATTAGAGCGAATGCACATTCCACATATGAAACAAGTTATTTCTCATGATAAAAAACATATTTCAGTGGCATTAATCTTGGCATGGCTTCTCGTTGGTTCATTGTCTCTCTGGTTTTATCGCTATGCACTAATCTCTCTACAGCCGACGTTTTCCTCAGCATCGACTGCGGATCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999975
ATGGCTTCTCGTTGGTTCATTGTCTCTCTGGTTTTATCGCTATGCACTAATCTCTCTACAGCCGACGTTTTCCTCAGCATCGACTGCGGATCGTCGTCGCCGTACACAGACAACAGCGGGGTCGCTTGGGTGGGCGACGACGAATACGTGAAGAGCGGCGAATCCCGTTCCATCAAGCCTCTGAATTCCATCTCCCACGTAGCGGACACCCTGCGGGTGTTCACTACGCGGAACAAGAACTGCTACCACATCGACTCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781671.1
MASRWFIVSLVLSLCTNLSTADVFLSIDCGSSSPYTDNSGVAWVGDDEYVKSGESRSIKPLNSISHVADTLRVFTTRNKNCYHIDSVKPGRVLVRASFYYGNYDGKNSPPTFALSFDGNVWTTVQTSNTSYYYYEVTYVMKRDSISVCLAQTEAEQFPFISALEVRRLEKYMYMHVDDGYPLFVWKRVAFRLKYRFRVPRRSLRQTMGCWSLCEWVDPRYG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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