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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000390`

染色体: Chr08 坐标: 2731599-2735256 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000390`
名称	SmilChr08G000390
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g05700
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2731599 - 2735256 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999981`
GeneID	`130999981`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999981`
原始查询	`SmilChr08G000390`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g05700
产物	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g05700
Arabidopsis	`AT1G05700` (AT1G05700) Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837077] identity=35.2; qcov=0.973; evalue=1.14e-70; confidence=medium
Rice	`Os12g0102500` - identity=32.5; qcov=1; evalue=5.91e-67; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF12819 (Malectin_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999981

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057781678.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057781678.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057781678.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781678.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781678.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2731806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B140,B27,B70,C43
`Chr8:2731826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B1,B7
`Chr8:2731851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B14
`Chr8:2731861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,B71,C62
`Chr8:2732364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B1,B7
`Chr8:2732542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C82
`Chr8:2732590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B9,C32,C45,C68,C78
`Chr8:2732971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:2733037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:2733046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr8:2733086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,C60
`Chr8:2733128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B118,C48,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781678.1

525 aa

262

525

Malectin_like

LRR_1

PF12819 Malectin_like 27-346 aa PF00560 LRR_1 423-444 aa PF00560 LRR_1 446-465 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781678.1`	Pfam	`PF12819`	Malectin_like	Domain	27	346	9.8e-71	239.4	Malectin-like domain
`XP_057781678.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	423	444	0.0002	21.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057781678.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	446	465	0.0002	21.5	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925695.1
ACACCAAAACAAAACAAAAAAAAAAGTTGATTTTCGAAGACAACTATCCTATTCCGAAATAATAAAGAAATAAATTCTGATTTCTCTACTATAAGTTGACTACAAAATTGTGAAGAGTAGTAATTCGATCGAATTCATCCAATCAAAGCATGGCTAAACTGCCACTAATCTCGTGCCTGCTCTTAGCTCTCTGCAGCCTATCTCTATCAGCAAATGTTTTCATCAGCATCGACTGCGGCTCATCGGCGACGTACAAGGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999981
ATGGCTAAACTGCCACTAATCTCGTGCCTGCTCTTAGCTCTCTGCAGCCTATCTCTATCAGCAAATGTTTTCATCAGCATCGACTGCGGCTCATCGGCGACGTACAAGGACGAGAACGGAATCTCATGGACAGGCGACGACGAGTACGTCGGCACGGGCGAGTCCCGTGCCGTGCAGCCGTCGAGCTCCTACAGCCGCGTGATGGACACGCTGCGCGTGTTCCGGAACCAGACCAAGCACTGCTACGTGATCGGCGACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781678.1
MAKLPLISCLLLALCSLSLSANVFISIDCGSSATYKDENGISWTGDDEYVGTGESRAVQPSSSYSRVMDTLRVFRNQTKHCYVIGDVKRGRVLVRATFLYGNYDGRNSPPAFDLLFDGYYWAYVNNSGPTPSRFEVIYTTTRETISVCVSQYEAGQFPYINAIEVRSLDSTMYGGLGEDRDIYPLFTRRRVAFGANATIRFPDDPYDRQWARDTFMNGTIQVTSDARLSSDIQTVDKPPLAVLKTAVTAPTLNSTIDFYL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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