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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000406`

染色体: Chr08 坐标: 2845636-2846735 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000406`
名称	SmilChr08G000406
描述	chitinase 2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2845636 - 2846735 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999996`
GeneID	`130999996`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999996`
原始查询	`SmilChr08G000406`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chitinase 2-like
产物	chitinase 2-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os10g0416100` (Rcb4) - identity=55.1; qcov=0.964; evalue=8.5e-111; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00704 (Glyco_hydro_18)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999996

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057781689.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057781689.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057781689.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781689.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781689.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2845979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B88,C57
`Chr8:2846015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B85,C52,C54
`Chr8:2846036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B72,C10
`Chr8:2846073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B27
`Chr8:2846075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr8:2846093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B15,B75,B83,C59
`Chr8:2846122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B97
`Chr8:2846132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B35,B82
`Chr8:2846138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B7
`Chr8:2846149`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B15
`Chr8:2846149`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B15
`Chr8:2846168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781689.1

307 aa

154

307

Glyco_hydro_18

PF00704 Glyco_hydro_18 94-221 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781689.1`	Pfam	`PF00704`	Glyco_hydro_18	Domain	94	221	1.2e-11	45.6	Glycosyl hydrolases family 18

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925706.1
AGTCCTAAATTCCCATAACTCAAATCATTTCAAAGAAATTAATACACTTCTCTCTACGATCTTTAACCAAATGGGCCCATCTCCACGTCATCCACTAGCTCTCTTGGTCTTCCAGGCCCTGATCATCGCCTCCTGCGCGAAATCAGGGCCCGCAAACTCGAACCTGTTCCGAGAATACCTCGGAGCAGAGTTCAAGAACGTGAAATTCTCCGACGTCCCGGTGAACTCGGGGGTCGAGTTCCACTACATCCTCTCGTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999996
ATGGGCCCATCTCCACGTCATCCACTAGCTCTCTTGGTCTTCCAGGCCCTGATCATCGCCTCCTGCGCGAAATCAGGGCCCGCAAACTCGAACCTGTTCCGAGAATACCTCGGAGCAGAGTTCAAGAACGTGAAATTCTCCGACGTCCCGGTGAACTCGGGGGTCGAGTTCCACTACATCCTCTCGTTCGCCATCGACTACACGACGGACCCGTCGTCGCCGTCCCCGACCGACGGCGAGTTCAACGTGTTCTGGGACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781689.1
MGPSPRHPLALLVFQALIIASCAKSGPANSNLFREYLGAEFKNVKFSDVPVNSGVEFHYILSFAIDYTTDPSSPSPTDGEFNVFWDTGNLSPGAVAAIKSRHPNVRVALSLGGDSVGDGESAFFAPSSPDTWVANAVSSLTRIIREYDLDGIDIDYEHFKADPATFARCVGRLITTLKANGVVSFASIAPFDDDEVQSHYMALWKDYGHVIDYVNFQFYAYDAGTTVEQFLRYFEEQSGNYGGGKVLPSFISDGSGGLAP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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