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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000408`

染色体: Chr08 坐标: 2860660-2864651 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000408`
名称	SmilChr08G000408
描述	putative respiratory burst oxidase homolog protein H
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2860660 - 2864651 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999998`
GeneID	`130999998`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999998`
原始查询	`SmilChr08G000408`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative respiratory burst oxidase homolog protein H
产物	putative respiratory burst oxidase homolog protein H
Arabidopsis	`AT5G60010` (AT5G60010) ferric reductase-like transmembrane component family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836123] identity=56.6; qcov=1.08; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0835500` (rbohE) - identity=63.2; qcov=0.938; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004601 (peroxidase activity); GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0016174 (NAD(P)H oxidase H2O2-forming activity)
KEGG	-
Pfam	PF01794 (Ferric_reduct); PF08022 (FAD_binding_8); PF08030 (NAD_binding_6); PF08414 (NADPH_Ox); PF13499 (EF-hand_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999998

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057781692.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781692.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781692.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781692.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781692.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2861038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr8:2861047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B52,B6,C2,C7
`Chr8:2861081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B104,B108,B3,B46
`Chr8:2861085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B104,B44,B7
`Chr8:2861087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C48,D7
`Chr8:2861161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B107,B89,C41
`Chr8:2861264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:2861405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B27,C29
`Chr8:2861453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B97,C57
`Chr8:2861465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr8:2861495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B44,B7
`Chr8:2861752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,B61,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781692.1

825 aa

412

825

NADPH_Ox

EF-hand_7

Ferric_reduct

FAD_binding_8

NAD_binding_6

PF08414 NADPH_Ox 57-160 aa PF13499 EF-hand_7 160-222 aa PF01794 Ferric_reduct 329-474 aa PF08022 FAD_binding_8 516-641 aa PF08030 NAD_binding_6 647-808 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781692.1`	Pfam	`PF08414`	NADPH_Ox	Family	57	160	1e-33	116.3	Respiratory burst NADPH oxidase
`XP_057781692.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	160	222	2.7e-07	31.5	EF-hand domain pair
`XP_057781692.1`	Pfam	`PF01794`	Ferric_reduct	Domain	329	474	1.9e-09	38.4	Ferric reductase like transmembrane component
`XP_057781692.1`	Pfam	`PF08022`	FAD_binding_8	Domain	516	641	1.7e-30	106.1	FAD-binding domain
`XP_057781692.1`	Pfam	`PF08030`	NAD_binding_6	Domain	647	808	4.4e-47	160.7	Ferric reductase NAD binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093628.1
CACAGATAAAAAATAAAGTCACTTTGAAAGGGACACTTTTGGAAGTCAGGAAAGCCATTGAAATAACTAATTTAACTAACTTTTCCATTTGATTGAATTTATCTACCCTTACACCTCAGACATATCTCTTCTTCCCTTTTCTTCTCCCTTTCTCCCAAAATTCAACCAAATCTCATACATTTCATACATACAATGATGCATCCTACAATTCCTTGATCTCTCACTACACAAAATGATGCATCCTACAATTCTTTGATCTC...

XM_057925709.1
CACAGATAAAAAATAAAGTCACTTTGAAAGGGACACTTTTGGAAGTCAGGAAAGCCATTGAAATAACTAATTTAACTAACTTTTCCATTTGATTGAATTTATCTACCCTTACACCTCAGACATATCTCTTCTTCCCTTTTCTTCTCCCTTTCTCCCAAAATTCAACCAAATCTCATACATTTCATACATACAATGATGCATCCTACAATTCCTTGATCTCTCACTACACAAAATGATGCATCCTACAATTCTTTGATCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999998
ATGGCATCTGAAAAGTCTGAAGATGATTCTGAAAAATGGGTTCTTGAGAAGATACACATTGATGACATGGCTGATGTGCAGATGGAAGATGGCAAGAAGCCGATTTCCTCGTCCACGTCTCGGTCCAGCAGTTTGAGGCAGAGGAAGGCGGCTGCGAGCTCCGGCCCTAAGATGGGGAGGATGGAATCCGGTGCCAAGAGAGGCCTAATGAGCCTCCGGTTTCTTGACAGGGCCAAGACCGGGAAGGAGGAGGACGCGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781692.1
MASEKSEDDSEKWVLEKIHIDDMADVQMEDGKKPISSSTSRSSSLRQRKAAASSGPKMGRMESGAKRGLMSLRFLDRAKTGKEEDAWRAIEKRFHQNSVDGMLFKDKFGACIGMGDSKEFAGELFEALARRRNVATTEKGIDLLQLRKFWEDMTNQDLDTRLHIFFDMCDKNGDGKLSEDEVKEVLVMSASANKLSKFKQEAATYAALIMEELDPDNQGYVEMWQLEALLRGMVGSEETQRSDRKADTLAKTMIPKEYRT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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