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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000414`

染色体: Chr08 坐标: 2946360-2951768 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000414`
名称	SmilChr08G000414
描述	L-ascorbate peroxidase 1, cytosolic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	2946360 - 2951768 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000004`
GeneID	`131000004`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000004`
原始查询	`SmilChr08G000414`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	L-ascorbate peroxidase 1, cytosolic-like
产物	L-ascorbate peroxidase 1%2C cytosolic-like
Arabidopsis	`AT1G07890` (APX1) ascorbate peroxidase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837304] identity=81.9; qcov=0.983; evalue=2.51e-139; confidence=high
Rice	`Os07g0694700` (APX2) - identity=80.4; qcov=0.974; evalue=1.71e-136; confidence=high
GO	GO:0000302 (response to reactive oxygen species); GO:0004601 (peroxidase activity); GO:0020037 (heme binding); GO:0034599 (cellular response to oxidative stress); GO:0042744 (hydrogen peroxide catabolic process)
KEGG	smil00053 (Ascorbate and aldarate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00480 (Glutathione metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00141 (peroxidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000004

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057781706.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057781707.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781706.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781706.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781706.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:2948642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C13
`Chr8:2948648`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C20
`Chr8:2948648`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C20
`Chr8:2949153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:2949177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr8:2949186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr8:2951463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B132,B17,B54,C70
`Chr8:2951494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr8:2951597`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781706.1

250 aa

125

250

peroxidase

PF00141 peroxidase 26-227 aa

XP_057781707.1

230 aa

115

230

peroxidase

PF00141 peroxidase 26-226 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781706.1`	Pfam	`PF00141`	peroxidase	Domain	26	227	1.2e-44	153.6	Peroxidase
`XP_057781707.1`	Pfam	`PF00141`	peroxidase	Domain	26	226	1.8e-44	153.0	Peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925723.1
ATTTTACTAATTTTCTCACCTACCATTAAAACATCACCCGTCTATTTAGACCGATCCCAGCCGTCCATTTCAAAACACAACTCAAGCCTCACGATCACCCCGATCCAACGATCACAATTACATCTTCTGGAAACTTCTCTCTCTTCGCAGCCCCCCCTTATATCTTACTAGTATATATCACTCCCACACTCACAATCCTCAGCTCAGTGCTTGTGTTGTCCACGCTCTCTACCCATCGTTAGGGTTTATACAATTTCTCT...

XM_057925724.1
ATTTTACTAATTTTCTCACCTACCATTAAAACATCACCCGTCTATTTAGACCGATCCCAGCCGTCCATTTCAAAACACAACTCAAGCCTCACGATCACCCCGATCCAACGATCACAATTACATCTTCTGGAAACTTCTCTCTCTTCGCAGCCCCCCCTTATATCTTACTAGTATATATCACTCCCACACTCACAATCCTCAGCTCAGTGCTTGTGTTGTCCACGCTCTCTACCCATCGTTAGGGTTTATACAATTTCTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000004
ATGGTGAAGAACTACCCAGCTGTGAGTGAGGAGTACTTGAAGGCTGTTGACAAATGCAAGAGGAAGCTCAGGGGTCTCATCGCTGAGAAGAATTGCGCTCCTATCATGCTCCGTCTTGCATGGCACTCTGCTGGTACATTTGATCAGTGCTCAAAAACTGGAGGTCCTTTTGGAACCATGAGATTCGAAGAGGAGCTTGCGCATGCTGCCAACAGTGGTCTTGATATTGCTTTGAGGCTCTTGGAGCCCATCAGGAAGCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057781706.1
MVKNYPAVSEEYLKAVDKCKRKLRGLIAEKNCAPIMLRLAWHSAGTFDQCSKTGGPFGTMRFEEELAHAANSGLDIALRLLEPIRKQFPTLSFADFYQLAGVVAVEVTGGPDVPFHPGRPDKAEPPVEGRLPDATKGSDHLRDVFTKQMGLTDQDIVALSGGHTLGRCHKERSGFEGPWTFNPLIFDNSYFTKLLSGEKEGLLQLPTDKTLLTDPCFRPFVEKYAADEDAFFADYAEAHMKLSELGFADA

XP_057781707.1
MVKNYPAVSEEYLKAVDKCKRKLRGLIAEKNCAPIMLRLAWHSAGTFDQCSKTGGPFGTMRFEEELAHAANSGLDIALRLLEPIRKQFPTLSFADFYQLAGVVAVEVTGGPDVPFHPGRPDKAEPPVEGRLPDATKGSDHLRDVFTKQMGLTDQDIVALSGGHTLGRCHKERSGFEGPWTFNPLIFDNSYFTKLLSGEKEGLLQLPTDKTLLTDPCFRPFVEKYAAVCAF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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