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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000422`

染色体: Chr08 坐标: 3011809-3013048 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000422`
名称	SmilChr08G000422
描述	uncharacterized SmilChr08G000422
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3011809 - 3013048 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000012`
GeneID	`131000012`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000012`
原始查询	`SmilChr08G000422`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823704]; symbol=AT3G45620; hit=AT3G45620; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823704]; symbol=AT3G45620; hit=AT3G45620; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G45620` (AT3G45620) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823704] identity=56.9; qcov=1.01; evalue=3.4e-106; confidence=high
Rice	`Os03g0286800` (OsWD40-67) - identity=51.1; qcov=1.01; evalue=1.81e-95; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0080008 (Cul4-RING E3 ubiquitin ligase complex)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000012

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781721.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057781721.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057781721.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057781721.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781721.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3011999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C36
`Chr8:3012320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,C12,C59
`Chr8:3012409`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C12,C59
`Chr8:3012409`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C12,C59
`Chr8:3012443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B39,C59
`Chr8:3012444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B15,B75
`Chr8:3012459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr8:3012480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B39,C59
`Chr8:3012482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:3012488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B104
`Chr8:3012488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:3012495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781721.1

280 aa

140

280

WD40

PF00400 WD40 104-140 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781721.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	104	140	1.7e-10	41.7	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925738.1
CCAGGCAGTCCATACGTATTTTACAGCTGTGGGGAGGATGGTTTTGTCCAACACTATGATCTACGAAGTTGCTCTGCTACCAAGCTTTTCTATTGCTCTTCATTCGCAGAAAACAGCCGGTCTTCAAGTGTCGGGCTGAATGCCATGGTTATTGACCCAAGAAATCCTAACTATTTTTCTGTAGGAAGTAGTGATGTTTACGCACGTTTGTATGACATCAGAAAATACCAAGTCAATGCATCAACTAAAGAAGGAAGCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000012
ATGGTTATTGACCCAAGAAATCCTAACTATTTTTCTGTAGGAAGTAGTGATGTTTACGCACGTTTGTATGACATCAGAAAATACCAAGTCAATGCATCAACTAAAGAAGGAAGCCCTGCCAACTACTTCTGCCCTCATCACCTTATCGGGAAAGACGATGTTCGCATTACAGCATTAGCTTACTCCAACACGAGCGAGCTGCTCGTCTCGTACAACGATGATCTCATATATCTGTTTCAGAGGAACATGGGTTTGGGTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781721.1
MVIDPRNPNYFSVGSSDVYARLYDIRKYQVNASTKEGSPANYFCPHHLIGKDDVRITALAYSNTSELLVSYNDDLIYLFQRNMGLGPKFTPSPSEDSPRPSEAQVFSGHRNFRTVKGVNFFGPNDEYVISGSDCGHIFIWKKKSCEVVRMMVGDRHVVNQLESHPLIPVLATCGIEKNVKLWSPSSNDVTPVPENVQEIMEGNRQGREDHSRVSFTPDLIMHVLRLHRRQAHVYVERRYNREDSGSDGDDDDDREEGYLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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