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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000430`

染色体: Chr08 坐标: 3085728-3086993 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000430`
名称	SmilChr08G000430
描述	interactor of constitutive active ROPs 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3085728 - 3086993 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997133`
GeneID	`130997133`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997133`
原始查询	`SmilChr08G000430`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	interactor of constitutive active ROPs 3-like
产物	interactor of constitutive active ROPs 3-like
Arabidopsis	`AT5G60210` (RIP5) ROP interactive partner 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836143] identity=41.8; qcov=1.13; evalue=1.86e-59; confidence=medium
Rice	`Os05g0122600` - identity=39.1; qcov=1.17; evalue=1.09e-43; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF27682 (ICR5_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997133

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057778377.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057778377.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057778377.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057778377.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778377.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3085867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B130,B91,C36
`Chr8:3085899`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B128,B27,B92,C30
`Chr8:3085899`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B128,B27,B92,C30
`Chr8:3085903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr8:3085904`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B128,B27,B92,C30
`Chr8:3085904`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B128,B27,B92,C30
`Chr8:3085909`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B128,B27,B92,C30
`Chr8:3085909`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B128,B27,B92,C30
`Chr8:3085944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr8:3085951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,C56,C83
`Chr8:3086000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B63,C50
`Chr8:3086009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778377.1

297 aa

148

297

ICR5_C

PF27682 ICR5_C 154-233 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778377.1`	Pfam	`PF27682`	ICR5_C	Domain	154	233	4.8e-18	66.6	Interactor of constitutive active ROPs 5 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922394.1
ATGAGTTTGTTGAAAGTTAGAAAGTTGTTGAGAGCCACGGAAGCGTATAACGCCATTGCTGCTGAGCTGGAGCAGTCGAGAGCCCGTGTTAATTTTCTCGAAGATCTGGTGAGCAAGCTCAAGGACTCCCAACGCGAAGACGTAGGTGAAACAGAAGTTAGTTCTTTGAAACTTGAAGTCGAGCAACTGAGATCGGCTTTAGAAGCCGGTGAGATAAGATACAACGAGGAACGAAGCCACAGTGCAGAGCAGATACGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997133
ATGAGTTTGTTGAAAGTTAGAAAGTTGTTGAGAGCCACGGAAGCGTATAACGCCATTGCTGCTGAGCTGGAGCAGTCGAGAGCCCGTGTTAATTTTCTCGAAGATCTGGTGAGCAAGCTCAAGGACTCCCAACGCGAAGACGTAGGTGAAACAGAAGTTAGTTCTTTGAAACTTGAAGTCGAGCAACTGAGATCGGCTTTAGAAGCCGGTGAGATAAGATACAACGAGGAACGAAGCCACAGTGCAGAGCAGATACGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778377.1
MSLLKVRKLLRATEAYNAIAAELEQSRARVNFLEDLVSKLKDSQREDVGETEVSSLKLEVEQLRSALEAGEIRYNEERSHSAEQIRDAMETVEKFKSASSQREAELEVEIRRSKYEIEELKANLMDKETELQGICEENEGLTTKLESSVSGQRENELKEMMSAGEVEESARAAEREVAVKVSYMAEEVEKSNRKAARVGEQLEAVQAANAEMEGELRRLKVQSDQWRKAAEAAAAMLSAGNNGQMMERTGSMDSHYNSPR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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