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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000438`

染色体: Chr08 坐标: 3137946-3139881 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000438`
名称	SmilChr08G000438
描述	LOB domain-containing protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3137946 - 3139881 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000030`
GeneID	`131000030`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000030`
原始查询	`SmilChr08G000438`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LOB domain-containing protein 1-like
产物	LOB domain-containing protein 1-like
Arabidopsis	`AT1G07900` (LBD1) LOB domain-containing protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837305] identity=69.9; qcov=0.808; evalue=6.05e-68; confidence=high
Rice	`Os03g0287400` - identity=73; qcov=0.712; evalue=1.23e-65; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03195 (LOB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000030

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781749.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781749.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781749.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781749.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057781749.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3138227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C24
`Chr8:3138251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,A23,A25,B139,C27
`Chr8:3138296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr8:3139508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:3139559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:3139616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C41,D1
`Chr8:3139713`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	51	A11,A18,A20,A23,A4,A5,B104,B11,B118,B12,B125,B126,B133,B136,B14,B140,B17,B2,B20,B22,B25,B26,B27,B28,B3,B31,B47,B62,B63,B70,B76,B8,B81,B89,B9,B93,B98,C21,C23,C24,C28,C36,C44,C47,C50,C60,C63,C74,C76,C85,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781749.1

177 aa

177

LOB

PF03195 LOB 31-128 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781749.1`	Pfam	`PF03195`	LOB	Family	31	128	1.3e-40	138.7	Lateral organ boundaries (LOB) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925766.1
ATTTTCAAAGAAAACGACGCGCCCCTCTGCTTTGATTTGCTCTATAAATTCTGAGCCTAACAACATCACATTAATTCATTTCCAACCTTATTTTATTTCTTTCTTTCTTTCTTCAACACTCAAAAATCTTTCTTCACTAACTACTAAAACCACATTCTTGAGAGAAAATGGAGGGCAGCGACATAACTGCAACTTCACCTTCTTCCTCATCATCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCAATCGGCGGTGGTGCTCAGCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000030
ATGGAGGGCAGCGACATAACTGCAACTTCACCTTCTTCCTCATCATCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCAATCGGCGGTGGTGCTCAGCCCCTGCGCCGCCTGCAAGATTCTGCGCCGCCGATGCGTCGAAAAATGTGTCCTCGCCCCTTATTTCCCGCCTCATGACCCTCTCAAGTTCACCACTGCTCATCGTGTCTTTGGTGCCAGCAATATTATCAAGTTCTTGCAGGAGCTTCCGGAGAGTCAAAGAGACGACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781749.1
MEGSDITATSPSSSSSPPPPPPPQSAVVLSPCAACKILRRRCVEKCVLAPYFPPHDPLKFTTAHRVFGASNIIKFLQELPESQRDDAVSSMVYEANARLREPVYGCAGAICQLQKQVNELHEQLAKAQAELVNVQCQNANLMAIICMEMSSQNNLAETTSFCDEGNLGFSCEHPLWA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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