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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000447`

染色体: Chr08 坐标: 3184483-3186868 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000447`
名称	SmilChr08G000447
描述	elongation factor 1-alpha-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3184483 - 3186868 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000028`
GeneID	`131000028`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000028`
原始查询	`SmilChr08G000447`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	elongation factor 1-alpha-like
产物	elongation factor 1-alpha-like
Arabidopsis	`AT1G07920` (AT1G07920) GTP binding Elongation factor Tu family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837307] identity=95.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0177400` (rfa1*) - identity=97.3; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003746 (translation elongation factor activity); GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0006412 (translation); GO:0006414 (translational elongation)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00009 (GTP_EFTU); PF03143 (GTP_EFTU_D3); PF03144 (GTP_EFTU_D2); PF22594 (GTP-eEF1A_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000028

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781747.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057781747.1`
3	Melanosome	Melanosome	0.20000	`XP_057781747.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781747.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781747.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3184795`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B71
`Chr8:3184795`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B71
`Chr8:3184802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B77,B95,C29,C51
`Chr8:3184817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B101,B62,B82,C61
`Chr8:3184928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr8:3184937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr8:3184994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B19
`Chr8:3185027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr8:3185030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:3185072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr8:3185096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr8:3185135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781747.1

449 aa

224

449

GTP_EFTU

GTP_EFTU_D2

GTP_EFTU_D3

GTP-eEF1A_C

PF00009 GTP_EFTU 6-223 aa PF03144 GTP_EFTU_D2 248-313 aa PF03143 GTP_EFTU_D3 322-429 aa PF22594 GTP-eEF1A_C 327-427 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781747.1`	Pfam	`PF00009`	GTP_EFTU	Domain	6	223	4.2e-59	200.0	Elongation factor Tu GTP binding domain
`XP_057781747.1`	Pfam	`PF03144`	GTP_EFTU_D2	Domain	248	313	5.6e-17	62.6	Elongation factor Tu domain 2
`XP_057781747.1`	Pfam	`PF03143`	GTP_EFTU_D3	Domain	322	429	1.3e-27	96.9	Elongation factor Tu C-terminal domain
`XP_057781747.1`	Pfam	`PF22594`	GTP-eEF1A_C	Domain	327	427	2.8e-37	127.9	GTP-eEF1A C-terminal domain-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925764.1
AATCCTTCCTTTAATTAGATGCGCTATTTATTAAAATTAATTTCACTCAATTATATCCGTCAGATCATCAAATCTAACGGTCACCAAAAACCCTAATCCCCACCTAGATTGTATATATATGTATGCTCATCTTCAACCATGCTGAAGCTCTCTCACTCACTACTGAGATCGCATAATTCTCTCACTACAATCGAAGGCGAGGCGAGAGAGCTCTCTGCATCAGCTACAACTCTCCATAGTGTTGTTTTGAGAGTTGGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000028
ATGGGTAAGGAGAAGGTTCACATTAACATTGTGGTGATCGGCCATGTGGACTCTGGAAAGTCGACCACCACCGGTCACTTGATCTACAAGCTCGGCGGTATCGACAAGCGTGTGATTGAGAGGTTTGAGAAGGAGGCCGCGGAGATGAACAAGAGGTCGTTCAAGTATGCGTGGGTGCTCGACAAGCTCAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGCATCACAATTGATATCGCCTTGTGGAAGTTTGAGACCACCAAGTACTACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781747.1
MGKEKVHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLDALDQINEPKRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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