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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000460`

染色体: Chr08 坐标: 3296876-3301848 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000460`
名称	SmilChr08G000460
描述	serine/threonine-protein kinase GRIK2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3296876 - 3301848 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000050`
GeneID	`131000050`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000050`
原始查询	`SmilChr08G000460`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase GRIK2-like
产物	serine/threonine-protein kinase GRIK2-like
Arabidopsis	`AT5G60550` (GRIK2) geminivirus rep interacting kinase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836176] identity=63.8; qcov=0.966; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0711300` - identity=54.5; qcov=1.02; evalue=6.41e-163; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0035556 (intracellular signal transduction)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF14531 (Kinase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000050

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057781787.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057781787.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057781787.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057781787.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781787.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3298139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B28
`Chr8:3298204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:3298659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B80,C42,C62
`Chr8:3299167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr8:3299803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr8:3300037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C41
`Chr8:3301364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B7,D5
`Chr8:3301398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781787.1

417 aa

208

417

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

Kinase-like

PF00069 Pkinase 123-384 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 127-380 aa PF14531 Kinase-like 231-361 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781787.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	123	384	1.1e-61	209.2	Protein kinase domain
`XP_057781787.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	127	380	3.5e-34	119.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057781787.1`	Pfam	`PF14531`	Kinase-like	Family	231	361	5.1e-07	29.9	Kinase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925804.1
GCTTTTGATGAACTTGGCACATGAGTTAACTTCATCATTTGTTTTATTTTATTGTTTGTTTGGATCCAAGGGGTAAATTACATTTTTGCCCTTAGAGCTCCCATACAAATTCCCCTCGTCTCTCTCCTCCCAAATCCTCACCTCGACCCGGTGGAGAACTCCGTCAATTCAGACAAAATCATCTCAATCATCGGATCCCACCGCTAAATCCCCACAAAGTTGCAGAGAAACTGAAACAAACTCGAATTTGTAGCAACTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000050
ATGTTCGCTAAGAGGAATTCGATTGAGAAAGTGACAGAAATGGGCTGCTGTGGGTGTTTTGGTTTCTCATTTGTGAAAAATCCCAAGAAGGTGATGAAACCCAGTAAGGCAATTAGCAAGAATATTTATGAGGAGTTATTGTTGAATGATGATCCTGAAGATGACCAGGGTAGTAGTTTCCAGAATGATGATATGAATGGATCTGGGAATGTAGATGACCTTGATTTCCAAAGCCCAGCAAAACGATCACAGGAGATTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781787.1
MFAKRNSIEKVTEMGCCGCFGFSFVKNPKKVMKPSKAISKNIYEELLLNDDPEDDQGSSFQNDDMNGSGNVDDLDFQSPAKRSQEILMHLIQHGLICREFPVKETYSVLRSEDEYGNKTINEYVRVRKIGAGSYGKVVLYQSRLHGTYYAIKVFHKSHLSKLRVSPSETALSDVLREVLIMKVLSHPNIVNLVEVIDDPTDDNLYMVLEYVEGKWVFDDAGPPGRLGEETARKYLRDVVSGLIYLHAHNIVHGDIKPDNL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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