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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000462`

染色体: Chr08 坐标: 3306051-3308078 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000462`
名称	SmilChr08G000462
描述	uncharacterized SmilChr08G000462
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3306051 - 3308078 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997137`
GeneID	`130997137`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997137`
原始查询	`SmilChr08G000462`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptide upstream protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831909]; symbol=CPUORF47; hit=AT5G03190; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	peptide upstream protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831909]; symbol=CPUORF47; hit=AT5G03190; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G03190` (CPUORF47) peptide upstream protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831909] identity=36.1; qcov=1.02; evalue=2.89e-98; confidence=medium
Rice	`Os07g0692401` - identity=27.4; qcov=0.791; evalue=4.06e-32; confidence=low
GO	GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF08241 (Methyltransf_11); PF25276 (DUF7870)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997137

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057778380.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057778380.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778380.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778380.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778380.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3306337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C55
`Chr8:3306423`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C53
`Chr8:3306423`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C53
`Chr8:3306553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr8:3306665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr8:3306699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C75
`Chr8:3306780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr8:3306828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,A25,B10,C26,C38
`Chr8:3306896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:3307056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,A2,B33,B60,B79
`Chr8:3307074`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B56
`Chr8:3307074`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778380.1

512 aa

256

512

Methyltransf_11

DUF7870

PF08241 Methyltransf_11 160-236 aa PF25276 DUF7870 423-510 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778380.1`	Pfam	`PF08241`	Methyltransf_11	Domain	160	236	8.6e-06	27.0	Methyltransferase domain
`XP_057778380.1`	Pfam	`PF25276`	DUF7870	Domain	423	510	4.3e-16	60.2	Domain of unknown function (DUF7870)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922397.1
CACTCACTCTCTCGCATTTATAGCCAGGAATCGGCGGCTGCCCTCCACTACTTCATCTCTCTCCCAGATCCAAATCTCCACCAATTCACGCCCAAATCAATCCCGCTGCTTCAACTATCACCATGTAAATTCCATCCCAGCCATGAATTAAGCTGCAAATTCAGTTCAAGATGGGTCCCAATCGGATGCTGCCGGCGGCGAAAAGGGTTCCGAGAAGGGTCTGGTTAGGGTTCCAAATGTCAATCGTATTACTGGTGGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997137
ATGGGTCCCAATCGGATGCTGCCGGCGGCGAAAAGGGTTCCGAGAAGGGTCTGGTTAGGGTTCCAAATGTCAATCGTATTACTGGTGGGTGGAAACCACACCTCCTCCAGGTTTTGCACTCGCATTGGTTCCGATTCTGAGGTAATGGAATTGAATTTCTTGAAATGGCAACTGCTCCGCGGCCCGATTGTGAGGCGTGTGTTGTTGAGGGCCTTTATGCTTGTGTTGGCACTGATTGTTATCTCTATGATGCAAATTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778380.1
MGPNRMLPAAKRVPRRVWLGFQMSIVLLVGGNHTSSRFCTRIGSDSEVMELNFLKWQLLRGPIVRRVLLRAFMLVLALIVISMMQIAREVRVIEPIISNIDDCPLNVGSNHGLNRTNLSKGFAFPVLGAPCVESENLVRAVFEELMEKKLLHSDARALCVGEGSSSAAVALRGLGLTNAVGVDRHPFFSLFQRRFVYELAFEDGSFDFAFSRDLDRVSVPALLVLEIERVLRPGGTGAMLVGGRRLYSGGLVRSAATVAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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