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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000471`

染色体: Chr08 坐标: 3353970-3354995 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000471`
名称	SmilChr08G000471
描述	protein S40-4
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3353970 - 3354995 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000060`
GeneID	`131000060`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000060`
原始查询	`SmilChr08G000471`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein S40-4
产物	protein S40-4
Arabidopsis	`AT5G60680` (AT5G60680) transcription initiation factor TFIID subunit (Protein of unknown function, DUF584) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836189] identity=54.8; qcov=1.04; evalue=1.56e-36; confidence=medium
Rice	`Os04g0520700` (OsS40-13) - identity=43.1; qcov=0.9; evalue=2.19e-27; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04520 (Senescence_reg)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000060

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057781803.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057781803.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057781803.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781803.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781803.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3354264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B140
`Chr8:3354347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B55,B62,B88,D6
`Chr8:3354359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:3354435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B26,B61,B80,B9
`Chr8:3354630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B45,B82,C11,C61,C69
`Chr8:3354663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781803.1

160 aa

160

Senescence_reg

PF04520 Senescence_reg 49-160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781803.1`	Pfam	`PF04520`	Senescence_reg	Family	49	160	5.8e-35	122.3	Senescence regulator

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925820.1
TTTTAGGAATTTTCAAAATATACCATAGCCGCAGAGATAAAAATACCAGCAAAGAGGCAGTTTAGAGAGAGAGTTGGGAGAGGAGAGTGAAAGAGAGAGCATTTGAAACCTTATCCATTTCGCCCCTTTATAAAAGCAGATCAAAACTCCAGTTTTGAAGTATCAAATTAACATAACAAAATCCCCATTCTTTTTTTCCTCTACACACAAGGGAAGAGAGCAGAGGCAGAATTGCTCAAGCAAAAAATTCTGATCGATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000060
ATGGCTGCGCCGAAAAGCTACTTCCCGAGAGCACACGACCGATTTCTCCCCACCGATCGGGAAATAACGAACAACTCGATGATCTTCGAGCTCGACGAATCGGAGGTGTGGAACTCCGACGGCCGCTCGCAGTCGCCGGATTTCCGCAAGCAGAGTTCCAGAGTATCCAGGAAGCCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGAGGGGATCGGCGACAGGACCTGCTTCTCTGCCGGTCAACATTCCTGACTGGTCGAAGATCCTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781803.1
MAAPKSYFPRAHDRFLPTDREITNNSMIFELDESEVWNSDGRSQSPDFRKQSSRVSRKPAAAAAARGSATGPASLPVNIPDWSKILKHEYRDNRRRDSDDDDFDFDEDEAAENGGRVPPHEFLARTRIASSVQEGIGRTLKGRDLNRVRNAIWLKVGFQD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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