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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000478`

染色体: Chr08 坐标: 3416194-3419478 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000478`
名称	SmilChr08G000478
描述	GATA transcription factor 11-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3416194 - 3419478 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000067`
GeneID	`131000067`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000067`
原始查询	`SmilChr08G000478`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GATA transcription factor 11-like
产物	GATA transcription factor 11-like
Arabidopsis	`AT1G08010` (GATA11) GATA transcription factor 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837316] identity=37.1; qcov=0.96; evalue=4.64e-50; confidence=medium
Rice	`Os12g0624900` (OsGATA25) - identity=76.5; qcov=0.211; evalue=4.54e-32; confidence=weak
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00320 (GATA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000067

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781809.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781809.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781809.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781809.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057781809.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3416556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr8:3416572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:3416648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,B80
`Chr8:3416727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C51
`Chr8:3416827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr8:3416908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B117,B72,B75,C35
`Chr8:3416928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B53,B98
`Chr8:3417026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B35,B44
`Chr8:3417145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr8:3417176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:3417833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B28
`Chr8:3417864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781809.1

323 aa

162

323

GATA

PF00320 GATA 232-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781809.1`	Pfam	`PF00320`	GATA	Domain	232	265	7.2e-15	55.0	GATA zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925826.1
GTGCATTCCCACTGTATCTCCCATGCACCATCACCGCACCCGATTACCAAAACTCACCATGAAAAAACCTTTTCATTTTTCCTAAAGTAAAACAACGTAAATGTACTTGCTTTTTTTCCCAATAAAGTCCAATTTGTACAGTTCAGACAAAGCCCACATTCTATCTTCTTACCCTATCTCTCCCACTCTCTCTTCTTGAAACCCTTTTCCCTTTTCTTTTTCAATTTTTCATTTCTCCCTTCCCTCTCTACAAAATTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000067
ATGGCTAAGGTTGACCCTTATGGTTGCTGGGATGGGGCTATTGATGGTGACGAAGAGTTGGAGAATATGCTCGGTAGCATCTTGGACTTTCCCGATTTTCCGATGGAGGGTTTGGAGGCGGAAGGATTTTCCGGCGATTGGGACGCTAGCAAGTCGCAGTATCTCGGGCCTATTCCGATGGACGTGCTAATGGGGCCACCAGCCGTTGCTCAAACCAAAGTCGAAACGGGGCCACAGGTTTTCATGCAAAGACCAGTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781809.1
MAKVDPYGCWDGAIDGDEELENMLGSILDFPDFPMEGLEAEGFSGDWDASKSQYLGPIPMDVLMGPPAVAQTKVETGPQVFMQRPVALIDAAPEAKKHSYWFGDDAAGSCIRRQNKSAEVQETGTFQSQSPVSVLESSSSSLTGKSLLKPHTAKRARSKRARPSGVSPWLLIPPLFSTSSRKSCDAKKTKERRKKLPHLPVAKQTTEDSSQSSDYAQPTNAAAAQLRPTKKCTHCEITKTPQWREGPLGPKTLCNACGVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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