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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000480`

染色体: Chr08 坐标: 3439265-3442740 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000480`
名称	SmilChr08G000480
描述	UDP-xylose transporter 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3439265 - 3442740 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000070`
GeneID	`131000070`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000070`
原始查询	`SmilChr08G000480`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UDP-xylose transporter 1-like
产物	UDP-xylose transporter 1-like
Arabidopsis	`AT2G28315` (AT2G28315) Nucleotide/sugar transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817378] identity=77.8; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0628200` - identity=72.9; qcov=0.988; evalue=4.32e-168; confidence=high
GO	GO:0005464 (UDP-xylose transmembrane transporter activity); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0015297 (antiporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF03151 (TPT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000070

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057781815.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057781815.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057781816.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057781815.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057781816.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3441030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C3
`Chr8:3441083`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	27	A24,A4,A5,B117,B131,B140,B29,B44,B48,B51,B57,B6,B77,B83,B95,C1,C14,C16,C18,C25,C46,C48,C51,C53,C6,C76,D9
`Chr8:3441144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B46,C8
`Chr8:3441384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C3
`Chr8:3441408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,C86
`Chr8:3441649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,C63,C67
`Chr8:3442033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr8:3442133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr8:3442316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B65,C64,C66,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781815.1

353 aa

176

353

TPT

PF03151 TPT 20-294 aa

XP_057781816.1

336 aa

168

336

TPT

PF03151 TPT 20-294 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781815.1`	Pfam	`PF03151`	TPT	Family	20	294	8.4e-20	72.0	Triose-phosphate Transporter family
`XP_057781816.1`	Pfam	`PF03151`	TPT	Family	20	294	8.2e-20	72.1	Triose-phosphate Transporter family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925833.1
CCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGGTTGGAGAGCACAAGAGGTTTGTTTGGCTCTAACTCCATCACTCCATCATGCACATATAATATGTTCACATTATTCCCACTTTAAATGATTTTGATGATCACATTAAAGATTCATTAGGCCACATGGTTTGTGAGTCCCTTGTCACTAAACTTGTACCAAATGTTAAATAAATACATCACTAATGTGAATGTGACTGG...

XM_057925832.1
GCACAAGAGGTTTGTTTGGCTCTAACTCCATCACTCCATCATGCACATATAATATGTTCACATTATTCCCACTTTAAATGATTTTGATGATCACATTAAAGATTCATTAGGCCACATGGTTTGTGAGTCCCTTGTCACTAAACTTGTACCAAATGTTAAATAAATACATCACTAATGTGAATGTGACTGGCCTCCAGAAAACAGAAGTACCTATATTCAAGAATATGTGTCTAACATAACTCTGTTTTTCATGAAAAAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000070
ATGGGGGAGATGTCAAACAACCAGCTGGGAGTGATGGGTGCACTGTTTCTCTCCGTCGCGTCGTCGGTGTCCATTGTCATCTGCAACAAGGCCCTGATGAGCAATCTTGGCTTCCAATTTGCCACAACACTCACCAGTTGGCACCTGATGGTAACATACTGCACCCTCCACGTCGCGTTGCGCCTGAATTTCTTCGAGAACAAGACAATCGACACGAAGACAGTGGTGCTCTTTGGCATCCTGAATGGTGTCTCCATTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057781815.1
MGEMSNNQLGVMGALFLSVASSVSIVICNKALMSNLGFQFATTLTSWHLMVTYCTLHVALRLNFFENKTIDTKTVVLFGILNGVSIGFLNLSLGFNSIGFYQMTKLAIIPFTVLLETLFLKKQFSDKIKISLSILLAGVGIASVTDLQLNMVGTILSLIAILTTCIGQILTNTIQKRLNVSSTQLLYQSSPFQAAILFVSGPLLDQCLTKQNVFAYTYSPVVMVFILLSCLIAVFVNFSTFLVIGKTSPVTYQVLGHLKT...

XP_057781816.1
MGEMSNNQLGVMGALFLSVASSVSIVICNKALMSNLGFQFATTLTSWHLMVTYCTLHVALRLNFFENKTIDTKTVVLFGILNGVSIGFLNLSLGFNSIGFYQMTKLAIIPFTVLLETLFLKKQFSDKIKISLSILLAGVGIASVTDLQLNMVGTILSLIAILTTCIGQILTNTIQKRLNVSSTQLLYQSSPFQAAILFVSGPLLDQCLTKQNVFAYTYSPVVMVFILLSCLIAVFVNFSTFLVIGKTSPVTYQVLGHLKT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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