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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000489`

染色体: Chr08 坐标: 3526022-3528583 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000489`
名称	SmilChr08G000489
描述	high-affinity nitrate transporter 2.1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3526022 - 3528583 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000078`
GeneID	`131000078`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000078`
原始查询	`SmilChr08G000489`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	high-affinity nitrate transporter 2.1-like
产物	high-affinity nitrate transporter 2.1-like
Arabidopsis	`AT1G08090` (NRT2:1) nitrate transporter 2:1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837327] identity=77.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0112600` (NRT2.1) - identity=76; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009705 (plant-type vacuole membrane); GO:0015112 (nitrate transmembrane transporter activity); GO:0015706 (nitrate transmembrane transport); GO:0071249 (cellular response to nitrate)
KEGG	smil00910 (Nitrogen metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000078

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057781825.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057781825.1`
3	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.40000	`XP_057781825.1`
4	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057781825.1`
5	Synaptic vesicle	Synaptic vesicle	0.20000	`XP_057781825.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3526912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr8:3526945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,D11
`Chr8:3526966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr8:3526987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:3527098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B56
`Chr8:3527178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,C11,C69
`Chr8:3527188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B54,B58,B83,B90,D9
`Chr8:3527192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B54,B58,B83,B90,D9
`Chr8:3527193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B54,B58,B83,B90,D9
`Chr8:3527230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B56,B96,D7
`Chr8:3527260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,A25
`Chr8:3527328`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781825.1

527 aa

264

527

MFS_1

PF07690 MFS_1 69-425 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781825.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	69	425	2.4e-21	76.8	Major Facilitator Superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925842.1
ACAAAAACACACAACTCCTTTTCAAAATTAAAATTACAACGAAATGGCCGGCATTGAAGGGTCTCCCGGCAGCTCGATGCATGGGGTCACCGGCAGGGAGCCCGTGCATGCCTTCTCCGTGGCGTCCCCGATTGTTCCGACGGACACCACGGCGAAGTTCGACCTGCCGGTGGACTCGGAGCACAAGGCCAAGCAATTCAAGCTGTTCTCGTTCGCGGCTCCTCACATGAGGACGTTCCATCTCTCGTGGATTTCCTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000078
ATGGCCGGCATTGAAGGGTCTCCCGGCAGCTCGATGCATGGGGTCACCGGCAGGGAGCCCGTGCATGCCTTCTCCGTGGCGTCCCCGATTGTTCCGACGGACACCACGGCGAAGTTCGACCTGCCGGTGGACTCGGAGCACAAGGCCAAGCAATTCAAGCTGTTCTCGTTCGCGGCTCCTCACATGAGGACGTTCCATCTCTCGTGGATTTCCTTCTTCACCTGCTTCGTGTCGACGTTCGCGGCGGCGCCGCTGGTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781825.1
MAGIEGSPGSSMHGVTGREPVHAFSVASPIVPTDTTAKFDLPVDSEHKAKQFKLFSFAAPHMRTFHLSWISFFTCFVSTFAAAPLVPIIRDNLNLTKSDIGNAGVASVSGSIFSRLVMGAVCDLLGPRYGCAFFVMLSAPTVFCMSFVSSAGGYVAVRFMIGFSLATFVSCQYWMSTMFNSKIIGTVNGTAAGWGNMGGGATQLIMPVLYDIIRNAGSTPFTAWRIAFFIPGWLHVIMGILVMTLGQDLPDGNLSALQEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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