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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000506`

染色体: Chr08 坐标: 3702000-3704368 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000506`
名称	SmilChr08G000506
描述	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3702000 - 3704368 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000098`
GeneID	`131000098`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000098`
原始查询	`SmilChr08G000506`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4
产物	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4
Arabidopsis	`AT2G28120` (AT2G28120) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817358] identity=69.9; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0800000` (OSJNBa0052F07.13) - identity=55.2; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF06813 (Nodulin-like); PF23262 (NFD4_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000098

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057781850.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057781850.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057781850.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781850.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781850.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3702556`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	62	A14,A15,A19,A20,A22,A4,A5,A7,B10,B101,B104,B106,B11,B112,B114,B122,B131,B135,B140,B16,B18,B22,B3,B35,B41,B42,B43,B44,B45,B48,B56,B59,B61,B65,B73,B74,B85,B88,B89,B91,B96,C10,C12,C16,C19,C28,C38,C39,C43,C46,C48,C5,C50,C51,C52,C58,C67,C7,C73,C82,C9,D6
`Chr8:3702557`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	59	A11,A16,A23,A9,B107,B110,B121,B123,B124,B125,B127,B136,B137,B14,B15,B21,B27,B28,B29,B30,B33,B34,B46,B52,B53,B55,B66,B70,B71,B81,B82,B94,B98,C2,C21,C25,C26,C3,C30,C36,C37,C4,C40,C41,C44,C49,C56,C65,C71,C75,C77,C8,C80,C83,C87,D1,D11,D2,D4
`Chr8:3702572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr8:3702573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B19,B58,B64,C48
`Chr8:3702712`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B62,C47
`Chr8:3702712`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B62,C47
`Chr8:3702909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,B83,C25,C53
`Chr8:3703167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr8:3703483`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	97	A14,A16,A20,A25,A8,B100,B103,B104,B105,B106,B111,B112,B113,B114,B117,B118,B120,B125,B127,B129,B13,B132,B14,B140,B16,B18,B19,B24,B26,B27,B30,B32,B35,B37,B42,B43,B45,B49,B5,B50,B53,B55,B57,B61,B62,B65,B66,B68,B69,B72,B73,B78,B79,B8,B83,B85,B86,B89,B9,B90,B92,B97,C1,C11,C14,C15,C17,C18,C24,C25,C26,C27,C31,C33,C38,C43,C48,C49,C52,C53,C59,C6,C64,C66,C69,C7,C72,C75,C76,C78,C8,C80,C82,C83,C86,D5,D8
`Chr8:3703520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:3703562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C76
`Chr8:3703692`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781850.1

571 aa

286

571

Nodulin-like

NFD4_C

PF06813 Nodulin-like 25-272 aa PF23262 NFD4_C 339-549 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781850.1`	Pfam	`PF06813`	Nodulin-like	Domain	25	272	1.3e-90	304.0	Nodulin-like
`XP_057781850.1`	Pfam	`PF23262`	NFD4_C	Domain	339	549	3.3e-15	57.2	NFD4, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925867.1
ACGTTTTCTATTTCCTTAATACCTGCCCTAATACACTCCAGGCAAATATTATATGAACTTGGACAATAGTAAATTAATTAGTTAATTAAATTTTTATCTATTATAAGCACAGTCGAATATATTGCGTCAGCAAGGAAACTGTAATGAGAAATGAAATGTGGTCCTGCCTCGTTCGAATGCATCACTACATATTTGTAGCCGTTACGTTGGCCTTGTATCCACTGTTGGAAAATCTTCAACCACCATTTATTCTCCACTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000098
ATGGTTGAAGCGACAGCAACCGGCGGCGGCGGCGGCGGCCGGCTGCGCTTCGCGGCGCACGTGATACGCGGGCGGTGGTTCTCCCTCTTCGCGTCGTTCCTGATCATGGCCGGCGCCGGCGCCACGTACCTCTTCGGCGTCTACTCGAAGGAGATCAAGGCGTCGCTGGGGTACGACCAGACCACGCTCAACCTCCTCGGATTCTTCAAAGACCTCGGCGCCAACTTCGGCGTGCTGTCGGGCCTCATCGCCGAGGTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781850.1
MVEATATGGGGGGRLRFAAHVIRGRWFSLFASFLIMAGAGATYLFGVYSKEIKASLGYDQTTLNLLGFFKDLGANFGVLSGLIAEVTPTWFVLLVGSAMNFTGYFMIWLAVTGRIAAPKVWQMCLYICIGANSQNFANTGALVTSVRNFPESRGSMIGLLKGFTGLSGAILTQVYLAVYGNDSKALILLIAWLPAALSVVFVFTIRELKVVRQTADELKIFYQFLYVSILLALFIMVMTILQKVLVGFPPAAYAASATVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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