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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000507`

染色体: Chr08 坐标: 3707370-3709422 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000507`
名称	SmilChr08G000507
描述	shugoshin-1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3707370 - 3709422 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000099`
GeneID	`131000099`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000099`
原始查询	`SmilChr08G000507`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	shugoshin-1-like
产物	shugoshin-1-like
Arabidopsis	`AT3G44960` (AT3G44960) shugoshin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823631] identity=40.9; qcov=0.885; evalue=3.58e-37; confidence=medium
Rice	`Os10g0457400` - identity=31.4; qcov=1.3; evalue=2.75e-30; confidence=low
GO	GO:0000775 (chromosome, centromeric region); GO:0005634 (nucleus); GO:0034090 (maintenance of meiotic sister chromatid cohesion); GO:0045144 (meiotic sister chromatid segregation)
KEGG	-
Pfam	PF07557 (Shugoshin_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000099

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781851.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057781851.1`
3	Cytoskeleton	细胞骨架	0.40000	`XP_057781851.1`
4	Spindle	Spindle	0.40000	`XP_057781851.1`
5	Centromere	着丝粒	0.20000	`XP_057781851.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3707746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B60,B95,C80,D2
`Chr8:3707882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,D11
`Chr8:3708134`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B90,B92
`Chr8:3708180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B117,B2,B4,B6,B77,C1,C36,C60,C74,C79
`Chr8:3708808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:3708854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B6,B85,C67,C76,D3
`Chr8:3709009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,C23,C57
`Chr8:3709182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr8:3709201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B85,C76,D3
`Chr8:3709233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B85,C76,D3
`Chr8:3709246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B85,C76,D3
`Chr8:3709257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B56,B89,B96,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781851.1

243 aa

122

243

Shugoshin_C

PF07557 Shugoshin_C 217-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781851.1`	Pfam	`PF07557`	Shugoshin_C	Motif	217	241	1.9e-06	28.3	Shugoshin C terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925868.1
GGAAATCCGTTGGAACCTCAAGAAATTTGAAACATTCTTTTGATTTTAATCTTTTGCTTTTCATCTTTCTTTCTTTTTTTCCTTTTACTTTCTCTAAACTCTTCCTTCTTTTTCGTCGCCCACGAATTCCATCCGTGGATGTCTGCAAATTTACTATTTCATCTCCAGACTAGGCGGATTTCTTGTCTCAGTTCGGGAAATTTGAGCGAAACCCAATTGATCCCGATTCATTTTATTCACAACCAATTTCGTGTTTTTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000099
ATGAAAGGGGATAGAATGTCAAAAAGATCTTCATTTGGAAGCATGGTGAGAAGGAGGCTCTCCGATATTACCAATTCTTTGCCTCAGCCTAAATCGCCGGCATTTCCTGAAAAAAATTTGCAATCTGATAATGCTTCTGCTAAGGAGCACATTGACCATCTTGTTAAGGAAAAGATGGCCTTGGTGAAGCTCATTCAAGAAAAGAATAAAATTATAGAATTGAGTGGAACTGAGGTTCAAAATTTGAGAACATGTCTTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781851.1
MKGDRMSKRSSFGSMVRRRLSDITNSLPQPKSPAFPEKNLQSDNASAKEHIDHLVKEKMALVKLIQEKNKIIELSGTEVQNLRTCLQKMQLQNWTLAQTNSHMLAEVNLGKQRLKALQHDVACKDTLLKTKILQLKEAEEVTEGSEMNEDARPRDASRRRRLSRSASLGSSTTSQQHAEMETALCKRRCVRRESGGGGYEAREEMLENVEAPRTSISRPSRKAVEKVQSYKERPLNIKMRRSQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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