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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000510`

染色体: Chr08 坐标: 3719393-3720692 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000510`
名称	SmilChr08G000510
描述	uncharacterized SmilChr08G000510
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3719393 - 3720692 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000102`
GeneID	`131000102`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000102`
原始查询	`SmilChr08G000510`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0153500; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0153500; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G09110` (AT3G09110) - identity=29.1; qcov=0.97; evalue=2.9e-17; confidence=low
Rice	`Os01g0153500` - identity=43.8; qcov=0.983; evalue=3.14e-56; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000102

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781854.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781854.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781854.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781854.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057781854.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3719760`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B22,B43,B91
`Chr8:3719760`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B22,B43,B91
`Chr8:3719782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C10
`Chr8:3719799`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	41	A10,A18,A24,B1,B11,B110,B113,B118,B121,B129,B134,B136,B137,B15,B17,B22,B35,B46,B50,B55,B59,B66,B69,B79,B89,B99,C1,C43,C44,C45,C6,C65,C66,C69,C70,C71,C77,C8,C82,C85,D1
`Chr8:3719808`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B131,B36,B87,C9
`Chr8:3719808`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B131,B36,B87,C9
`Chr8:3719809`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	51	A10,A18,A24,B1,B11,B110,B113,B118,B121,B129,B134,B135,B136,B137,B15,B17,B22,B27,B35,B42,B46,B50,B55,B59,B66,B69,B73,B78,B79,B89,B9,B92,B99,C1,C22,C43,C44,C45,C58,C59,C6,C65,C66,C69,C70,C77,C8,C82,C83,C85,D1
`Chr8:3719810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B36,B62,B87,C9
`Chr8:3719821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B70,C61
`Chr8:3719868`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	149	A10,A11,A13,A15,A18,A19,A2,A21,A22,A3,A6,B100,B101,B102,B103,B107,B108,B109,B11,B110,B112,B113,B117,B118,B119,B12,B121,B124,B125,B126,B128,B13,B130,B131,B132,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B17,B18,B2,B20,B22,B25,B26,B3,B31,B34,B36,B37,B41,B44,B46,B47,B50,B57,B59,B60,B62,B64,B67,B69,B7,B71,B73,B78,B8,B80,B81,B83,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B94,B97,B98,B99,C1,C10,C12,C13,C14,C16,C19,C21,C22,C23,C25,C27,C28,C29,C30,C31,C32,C33,C35,C36,C37,C38,C40,C41,C42,C43,C45,C46,C47,C51,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C62,C63,C64,C65,C67,C68,C69,C70,C71,C72,C74,C76,C77,C78,C79,C81,C82,C84,C85,C9,D1,D10,D2,D3,D6,D7
`Chr8:3719871`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	192	A10,A11,A13,A14,A15,A18,A19,A2,A21,A22,A23,A24,A3,A4,A5,A6,A7,B1,B100,B101,B102,B103,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B117,B118,B119,B12,B121,B122,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B14,B140,B15,B17,B18,B19,B2,B20,B22,B23,B25,B26,B28,B3,B31,B32,B34,B35,B36,B37,B4,B40,B41,B44,B46,B47,B5,B50,B53,B54,B55,B56,B57,B59,B60,B62,B63,B64,B67,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B74,B76,B78,B79,B8,B80,B81,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B93,B94,B95,B97,B98,B99,C1,C10,C12,C13,C14,C16,C17,C19,C21,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C30,C31,C32,C33,C35,C36,C37,C38,C39,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C74,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C9,D1,D10,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr8:3719875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B56,B96,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781854.1

237 aa

118

237

DUF674

PF05056 DUF674 3-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781854.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	3	228	2.3e-34	119.8	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925871.1
AATAGGAATCATTTCCTAAAATAAGGGTTGGGAAAATCGTTTGGGTTGAATGGAGGACAAATTAGTGTTCAAATTAGATCATTAATATTTGAAGGGTATTATGGCAGCTATAATTATGGCTCCATATAATTTCCCTTAATATTTATCAACAGTAACGGAAACCCAATTTCTCTCATGATTGCAGAGGGATATGAATTTATGATAATTAAATAGAAACGCAAGCATTATTACTTCACTAAGCTTTTCATCTGCACCAATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000102
ATGGCGAATCCGACGGTGAGCATGAAGCTGTTGATCGACACTAGCAAAGTGAGACGCGTCTTGTTCGCGGAGGCCGGCAAAGACTGCGTGGATTTCCTCTTCCACATACTGTCTGCGCCGCTTGCCACCGTCATCAGCCTTCTCAGAGAGGAAGGAATGGAGGGCTCTTTGCCCAACCTCTTCAAAAGCTTAGAAGATCTCAACGACACCTACATACTGCCGGGCAAGAACAAGGAGGCGTTTCTGAAACCGGCGGCGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781854.1
MANPTVSMKLLIDTSKVRRVLFAEAGKDCVDFLFHILSAPLATVISLLREEGMEGSLPNLFKSLEDLNDTYILPGKNKEAFLKPAAPVSSSSVPLLALTGSQIQTVFYRCTNHYNNSSCRNYVSDDPRATCPSCRGVLSSTMTYVGPPAVVEAAEGGGLVKGVVTYMVMDDLEIKPMSTISSIALLNKFNVKEVGALEEKVVTLGMNEAIKLLKASLETKNVLTRVFCDAIDELKKC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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