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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000523`

染色体: Chr08 坐标: 3810500-3814691 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000523`
名称	SmilChr08G000523
描述	protein SOSEKI 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3810500 - 3814691 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000112`
GeneID	`131000112`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000112`
原始查询	`SmilChr08G000523`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SOSEKI 3-like
产物	protein SOSEKI 3-like
Arabidopsis	`AT2G28150` (AT2G28150) UPSTREAM OF FLC protein (DUF966) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817361] identity=56; qcov=1.02; evalue=2.52e-169; confidence=high
Rice	`Os03g0692400` (OsDSR5) - identity=45.4; qcov=0.925; evalue=1.64e-123; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06136 (SOK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000112

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057781862.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057781862.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057781862.1`
4	Cytoskeleton	细胞骨架	0.20000	`XP_057781862.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781864.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3811473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:3811823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B121,B125
`Chr8:3811850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr8:3811865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B121,B125
`Chr8:3812375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B88
`Chr8:3812387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B16,B45,C28,C9
`Chr8:3812492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr8:3812579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,C16
`Chr8:3812580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,C59,D8
`Chr8:3812630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C80
`Chr8:3812696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B88
`Chr8:3812697`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C42,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781862.1

551 aa

276

551

SOK

PF06136 SOK 42-130 aa

XP_057781863.1

551 aa

276

551

SOK

PF06136 SOK 42-130 aa

XP_057781864.1

550 aa

275

550

SOK

PF06136 SOK 42-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781862.1`	Pfam	`PF06136`	SOK	Domain	42	130	8e-51	171.0	SOSEKI protein DIX-like domain
`XP_057781863.1`	Pfam	`PF06136`	SOK	Domain	42	130	8e-51	171.0	SOSEKI protein DIX-like domain
`XP_057781864.1`	Pfam	`PF06136`	SOK	Domain	42	130	8e-51	171.0	SOSEKI protein DIX-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925880.1
GAATTTCATGTCAACATGAAAAGGGTAGTAAAGAGCTCCTCCTCCTCACTCCTCGCTCCATCATCAACAACAACAACAACAAACCTCTGAATTTCTCTAACCTCAGGCATAACGCCAAATCAACTCCCACCTCCATCTCCACGCATCAGTCCCTTTCTGCAATCGTTGTCTCTCTAGTGTCTAGTCACACTTCACCCTCTAGCAAGCTCTGTCGCCAACACACAGTGGCCACACTGCTGCATTTAATGTGGGCCTCCTCT...

XM_057925879.1
GAATTTCATGTCAACATGAAAAGGGTAGTAAAGAGCTCCTCCTCCTCACTCCTCGCTCCATCATCAACAACAACAACAACAAACCTCTGAATTTCTCTAACCTCAGGCATAACGCCAAATCAACTCCCACCTCCATCTCCACGCATCAGTCCCTTTCTGCAATCGTTGTCTCTCTAGTGTCTAGTCACACTTCACCCTCTAGCAAGCTCTGTCGCCAACACACAGTGGCCACACTGCTGCATTTAATGTGGGCCTCCTCT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131000112
ATGGAGAGAACGAAGAAATTTAGGCAAGTCAGCCCAGAACGGGCCAAAGTGTGGAAAGAAAAATCGCCCAAGTATCATTACAATCACCACTACGATCAGCAGCCGCCGCAGCACAACCAGAAGGTGCCGGTAGTTTACTATCTATCTCGAAATCGACAACTCGAGCATCCCCATTTCATGGAGGTCCCCCTGTCCTCTCCTGATGGCCTTTACTTGAGAGATGTGATTGAGAGGCTTAATGCGTTGAGAGGCCGAGGCAT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057781862.1
MERTKKFRQVSPERAKVWKEKSPKYHYNHHYDQQPPQHNQKVPVVYYLSRNRQLEHPHFMEVPLSSPDGLYLRDVIERLNALRGRGMASIYSWSCKRSYKNGYVWHDLCDDDLILPAHGNEYILKGSELFEDSNSGNFSPAETVILHNQKALPEPPSSRSQEESSSSSSLNDRTTKTSQEDELSPPDQRPCSSSVSPECSTEKNSSWNGSLSLTEYKIYKSDGLADASTQTEDNANRGARARDTCMRGVSTDDGLAEPES...

XP_057781863.1
MERTKKFRQVSPERAKVWKEKSPKYHYNHHYDQQPPQHNQKVPVVYYLSRNRQLEHPHFMEVPLSSPDGLYLRDVIERLNALRGRGMASIYSWSCKRSYKNGYVWHDLCDDDLILPAHGNEYILKGSELFEDSNSGNFSPAETVILHNQKALPEPPSSRSQEESSSSSSLNDRTTKTSQEDELSPPDQRPCSSSVSPECSTEKNSSWNGSLSLTEYKIYKSDGLADASTQTEDNANRGARARDTCMRGVSTDDGLAEPES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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