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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000541`

染色体: Chr08 坐标: 3941348-3945601 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000541`
名称	SmilChr08G000541
描述	uncharacterized SmilChr08G000541
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3941348 - 3945601 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000130`
GeneID	`131000130`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000130`
原始查询	`SmilChr08G000541`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Serine carboxypeptidase S28 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832349]; symbol=AT5G22860; hit=AT5G22860; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Serine carboxypeptidase S28 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832349]; symbol=AT5G22860; hit=AT5G22860; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G22860` (AT5G22860) Serine carboxypeptidase S28 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832349] identity=54.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0647400` (OsProCP2) - identity=44.2; qcov=0.929; evalue=4.93e-131; confidence=medium
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008239 (dipeptidyl-peptidase activity); GO:0070008 (serine-type exopeptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF05577 (Peptidase_S28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000130

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057781886.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057781886.1`
3	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057781886.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781886.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781886.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3942693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr8:3942920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B97
`Chr8:3942926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B67,C23,C57
`Chr8:3943276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B44
`Chr8:3943276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:3943323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B41,D5
`Chr8:3943335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr8:3943364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:3943368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B50,C3,C34
`Chr8:3943375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B33,B46,B80,C76
`Chr8:3943388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:3943420`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B81,C33,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781886.1

494 aa

247

494

Peptidase_S28

PF05577 Peptidase_S28 57-472 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781886.1`	Pfam	`PF05577`	Peptidase_S28	Domain	57	472	1e-72	246.1	Serine carboxypeptidase S28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925903.1
AGACATGAATTCCTTCCAATTCTACCCTCTCATTCTTCTTGTTGTGTTTTCGGTATTTCTGCAAACTGCTTCAAGCAAAATTCCAAGGCTCTCAATCCACCATAAGCAAGCTTTAAATCGCGACAAGGGTTTGAGTGTAAATTCAGATGGTTTTGAGAAATATTACTACACACAAACCCTTGATCATTTCAACTACGCACCACAAAGCTATGCAAGTTTCAGACAGCAATATGTGGTGAACTCCAAATATTGGGGCGGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000130
ATGAATTCCTTCCAATTCTACCCTCTCATTCTTCTTGTTGTGTTTTCGGTATTTCTGCAAACTGCTTCAAGCAAAATTCCAAGGCTCTCAATCCACCATAAGCAAGCTTTAAATCGCGACAAGGGTTTGAGTGTAAATTCAGATGGTTTTGAGAAATATTACTACACACAAACCCTTGATCATTTCAACTACGCACCACAAAGCTATGCAAGTTTCAGACAGCAATATGTGGTGAACTCCAAATATTGGGGCGGTCCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781886.1
MNSFQFYPLILLVVFSVFLQTASSKIPRLSIHHKQALNRDKGLSVNSDGFEKYYYTQTLDHFNYAPQSYASFRQQYVVNSKYWGGPDSNSPIFAYLGAEQPLNFDVVNYIGIINDNVPYFKALSVFIEHRYYGESIPFGTMEEALKNKTTRGYFNSAQALADYAEILLHVKQKFSAHNSPIIVFGGSYGGMLASWFRLKYPHIALGALASSAPILYFDNIVQNGYFSVVTKDFKKASRSCYNTIRKSWAEIDYIASKPGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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