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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000548`

染色体: Chr08 坐标: 3990043-3991977 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000548`
名称	SmilChr08G000548
描述	uncharacterized SmilChr08G000548
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3990043 - 3991977 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000139`
GeneID	`131000139`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000139`
原始查询	`SmilChr08G000548`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	recQ-mediated instability-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837359]; symbol=AT1G08390; hit=AT1G08390; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	recQ-mediated instability-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837359]; symbol=AT1G08390; hit=AT1G08390; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G08390` (AT1G08390) recQ-mediated instability-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837359] identity=55.8; qcov=1.11; evalue=5.04e-49; confidence=medium
Rice	`Os03g0684300` - identity=42.4; qcov=1.16; evalue=1.34e-28; confidence=medium
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0006281 (DNA repair); GO:0016607 (nuclear speck); GO:0033045 (regulation of sister chromatid segregation); GO:0043007 (maintenance of rDNA); GO:2000042 (negative regulation of double-strand break repair via homologous recombination)
KEGG	smil03460 (Fanconi anemia pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF16100 (RMI2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000139

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781897.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781898.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057781898.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057781897.1`
5	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057781898.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3991308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781897.1

138 aa

138

RMI2

PF16100 RMI2 6-127 aa

XP_057781898.1

124 aa

124

RMI2

PF16100 RMI2 6-71 aa PF16100 RMI2 84-113 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781897.1`	Pfam	`PF16100`	RMI2	Domain	6	127	7.2e-33	113.9	RecQ-mediated genome instability protein 2
`XP_057781898.1`	Pfam	`PF16100`	RMI2	Domain	6	71	1.4e-24	87.1	RecQ-mediated genome instability protein 2
`XP_057781898.1`	Pfam	`PF16100`	RMI2	Domain	84	113	1.4e-24	87.1	RecQ-mediated genome instability protein 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925915.1
ATTGGTAAATTTTATATACTTTGTATAATAAAAATGGATACATTTAATATTTTCTTTTTGAAAATTGGTACATACTATACTATTTTCACTCATATAAAATGCCTTATTCATAGATGCACAATTACGCATAAACCAATGAACACTTACGCATAAACCAATGAACATCAAAGTTCAACGTTTCTACTGTGCCAATTTGAAAAAATTTTGAGGGAAGAGAAAGAAAGGGGAAAAAGATGGATTTCAATCAAGCAGCATTAAAG...

XM_057925914.1
ATGGATACATTTAATATTTTCTTTTTGAAAATTGGTACATACTATACTATTTTCACTCATATAAAATGCCTTATTCATAGATGCACAATTACGCATAAACCAATGAACACTTACGCATAAACCAATGAACATCAAAGTTCAACGTTTCTACTGTGCCAATTTGAAAAAATTTTGAGGGAAGAGAAAGAAAGGGGAAAAAGATGGATTTCAATCAAGCAGCATTAAAGCTGCTGTGTGCGCAACTGAAAAACGCCCGCCAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000139
ATGGATTTCAATCAAGCAGCATTAAAGCTGCTGTGTGCGCAACTGAAAAACGCCCGCCAAACGCCGTCGCAGAAGGCCTTCAGTCTCGGCGGCATCCTCTTCCAACGCGCTTGGATTCAGGGGGTTCTAGTCTCCGTACCTTCGGTATCTGACTATGGTGAGAGCGGCCGCTTCCTTCTAGACGACGGCACCGGCGTCATTGAACTATCGCTCTCCCGCGACTTCCGCGGCCGCCACTGGGAATCAGGTGATCTGCCATT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057781897.1
MDFNQAALKLLCAQLKNARQTPSQKAFSLGGILFQRAWIQGVLVSVPSVSDYGESGRFLLDDGTGVIELSLSRDFRGRHWESGMYLMVVGGFNVRAGDLPLIKVHKIVDLSPFPDRESMWYLEVMEAFKLFYEPLFQE

XP_057781898.1
MDFNQAALKLLCAQLKNARQTPSQKAFSLGGILFQRAWIQGVLVSVPSVSDYGESGRFLLDDGTGVIELSLSRDFRGRHWESGDLPLIKVHKIVDLSPFPDRESMWYLEVMEAFKLFYEPLFQE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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