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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000557`

染色体: Chr08 坐标: 4049489-4052615 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000557`
名称	SmilChr08G000557
描述	glucomannan 4-beta-mannosyltransferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4049489 - 4052615 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000147`
GeneID	`131000147`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000147`
原始查询	`SmilChr08G000557`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucomannan 4-beta-mannosyltransferase 1-like
产物	glucomannan 4-beta-mannosyltransferase 1-like
Arabidopsis	`AT5G22740` (CSLA02) cellulose synthase-like A02 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832337] identity=59; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0625700` (OsCslA9) - identity=56; qcov=0.979; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0051753 (mannan synthase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00535 (Glycos_transf_2); PF13506 (Glyco_transf_21); PF13632 (Glyco_trans_2_3); PF13641 (Glyco_tranf_2_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000147

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057781908.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057781908.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057781908.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057781908.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781908.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4049866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr8:4050077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr8:4050254`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr8:4050846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B29,C24
`Chr8:4050881`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A16,B29,B47,B64,B77,B80,B85,C24,C28,C33,C59,C75,C76,C83
`Chr8:4050884`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	A16,B29,B47,B64,B77,B80,C24,C28,C33,C59,C75,C76,C83
`Chr8:4050907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B137,B65,C62
`Chr8:4050908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr8:4051643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:4051732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:4052009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,D9
`Chr8:4052016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781908.1

532 aa

266

532

Glyco_tranf_2_3

Glycos_transf_2

Glyco_transf_21

Glyco_trans_2_3

PF13641 Glyco_tranf_2_3 96-329 aa PF00535 Glycos_transf_2 99-254 aa PF13506 Glyco_transf_21 187-327 aa PF13632 Glyco_trans_2_3 187-380 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781908.1`	Pfam	`PF13641`	Glyco_tranf_2_3	Domain	96	329	5.1e-18	66.3	Glycosyltransferase like family 2
`XP_057781908.1`	Pfam	`PF00535`	Glycos_transf_2	Domain	99	254	5.8e-10	40.1	Glycosyl transferase family 2
`XP_057781908.1`	Pfam	`PF13506`	Glyco_transf_21	Domain	187	327	1.7e-06	27.9	Glycosyl transferase family 21
`XP_057781908.1`	Pfam	`PF13632`	Glyco_trans_2_3	Domain	187	380	1.2e-25	91.2	Glycosyl transferase family group 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925925.1
TTCCATCTCTCCCACGTGACGAGAAAACGCCAAAAATACCATGTCCTTCTACACGAATCATGATGAACTACAAATTAGCAACCCCACACCGATTGAAAATGCTTTCTTGATGATCTTCTATCAAATTATCTCACAGCCATTTTGATCTTTCTCATTTTGGGTAACTGCAGTCCACCAAATCTTCCCCACCTTATGTAGAAGCATTCAAGCAAAGCAATTACCGAATGTTGATCTAGAGGAAACAGAGCATCACCCGTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000147
ATGGCCGAGATGTCCGTGAGGGATTTCGTGATGGGATGGGTGGTGGGGTCGTCGGCGGAGAGAATGGGGCAGCTGTGGGGCACAGTGAAAGTAACATTCATGGCGCGGGGAGTGAGATTTGGTCTATTTATTTGCTTGATAATGTCGACGATGCTGTTCGTGGAGTGGGTTTACATTGGGGTGGCTGTTGCATACGTGAAGCTGTACAAGAGGAAGCCCGAGAAGAGGTACAAATGGGAGGCGATTGAGGCCGACCCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781908.1
MAEMSVRDFVMGWVVGSSAERMGQLWGTVKVTFMARGVRFGLFICLIMSTMLFVEWVYIGVAVAYVKLYKRKPEKRYKWEAIEADPETGNAPFPMLLVQIPIFNEKEVFKLSIGAACKLSWPADRLLIQVMDGSTDTLVKEMVEKECVRWASEGINIRYQSRNTREGFKAGALREGLGYDYVQECQHVAIFDSDFQPDPDFLRRAVPFLLHNPDVALVQARWRFVNADECLLTRLQEMSLDYHFIAEQEVGSSIYEFFGF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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