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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000585`

染色体: Chr08 坐标: 4334943-4336256 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000585`
名称	SmilChr08G000585
描述	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4334943 - 4336256 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997966`
GeneID	`130997966`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997966`
原始查询	`SmilChr08G000585`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
产物	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
Arabidopsis	`AT3G26040` (AT3G26040) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822201] identity=28.9; qcov=1.03; evalue=9e-56; confidence=low
Rice	`Os02g0611800` (OsHCT2) - identity=25.2; qcov=1.02; evalue=1.92e-21; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997966

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779387.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057779387.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057779387.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779387.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779387.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4334963`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	136	A1,A10,A13,A15,A16,A19,A2,A20,A22,A23,A25,A6,A7,A8,B10,B102,B109,B11,B110,B111,B113,B114,B117,B119,B120,B121,B122,B124,B125,B129,B130,B131,B132,B134,B135,B136,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B18,B19,B21,B22,B23,B26,B30,B37,B41,B42,B49,B5,B52,B53,B55,B6,B61,B64,B70,B71,B73,B77,B78,B79,B8,B82,B84,B87,B89,B90,B91,B92,B93,B97,B99,C11,C12,C13,C15,C16,C17,C18,C20,C21,C28,C30,C32,C34,C35,C36,C38,C39,C42,C43,C44,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C54,C56,C58,C59,C60,C61,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C71,C73,C74,C75,C77,C78,C79,C81,C83,C84,C86,C87,C9,D11,D3,D4,D5,D6,D9
`Chr8:4335031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	116	A1,A10,A11,A14,A16,A2,A21,A3,A4,A5,A9,B1,B100,B103,B106,B107,B108,B109,B115,B118,B119,B12,B121,B125,B126,B127,B132,B133,B136,B137,B139,B20,B22,B24,B33,B34,B35,B37,B38,B39,B40,B44,B45,B46,B50,B52,B54,B55,B56,B57,B58,B62,B63,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B77,B8,B80,B83,B86,B87,B89,B9,B93,B94,B95,B96,B98,C13,C18,C19,C2,C22,C23,C24,C25,C26,C28,C29,C31,C33,C34,C4,C40,C42,C45,C47,C49,C53,C55,C58,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C7,C70,C73,C75,C82,C85,D10,D2,D3,D5,D7,D8,D9
`Chr8:4335125`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B10,C80
`Chr8:4335125`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B10,C80
`Chr8:4335214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr8:4335222`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B10
`Chr8:4335222`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B10
`Chr8:4335223`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B10
`Chr8:4335223`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B10
`Chr8:4335365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,C82
`Chr8:4335407`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B128,B13,B56,B92,C20,C29,C43,D11
`Chr8:4335483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B66,B8,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779387.1

437 aa

218

437

Transferase

PF02458 Transferase 5-425 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779387.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	5	425	1.7e-60	205.7	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923404.1
ATGAAGAAGAACAAAATCAGCAGCAAGTTGATAAAACCACACACCCCAACCCCTCAAAACCTCAAGAATTACAAGTTATCATTTATCGATGAAATTGTTCCCCCAGTCAATATTGCTGTTATTCTGTTTTACCAATCGAAACCCGAAAACGGCAGCCTCCAGTTGGAAGAATCACTGGCCAGAATCTTGGTTGATTTCTATCCTCTTGCAGGAAGATTCATCAATAATTATAGTTCGATTGACTGCTGCGACGAGGGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997966
ATGAAGAAGAACAAAATCAGCAGCAAGTTGATAAAACCACACACCCCAACCCCTCAAAACCTCAAGAATTACAAGTTATCATTTATCGATGAAATTGTTCCCCCAGTCAATATTGCTGTTATTCTGTTTTACCAATCGAAACCCGAAAACGGCAGCCTCCAGTTGGAAGAATCACTGGCCAGAATCTTGGTTGATTTCTATCCTCTTGCAGGAAGATTCATCAATAATTATAGTTCGATTGACTGCTGCGACGAGGGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779387.1
MKKNKISSKLIKPHTPTPQNLKNYKLSFIDEIVPPVNIAVILFYQSKPENGSLQLEESLARILVDFYPLAGRFINNYSSIDCCDEGAELAEAEALDVELIDLVAKINVDQIDNLLPYKHFPQNGAPDNPILSIQITRFSCGGAAIAISVSHRIFDASSIVTFVNAWTDANNPDDAKRVITPSFHLPSLLPSVIPNDNLAPAPAPASVSGHKAVLKRVLFNKEALRRLKSRIRHPNGKPLSGVRVVAAVMAKAQFRLDRAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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