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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000586`

染色体: Chr08 坐标: 4359356-4364001 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000586`
名称	SmilChr08G000586
描述	premnaspirodiene oxygenase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4359356 - 4364001 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000168`
GeneID	`131000168`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000168`
原始查询	`SmilChr08G000586`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	premnaspirodiene oxygenase-like
产物	premnaspirodiene oxygenase-like
Arabidopsis	`AT3G26310` (CYP71B35) cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 35 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822235] identity=38.7; qcov=0.957; evalue=3.37e-104; confidence=medium
Rice	`Os09g0275400` - identity=42.4; qcov=0.884; evalue=8.3e-123; confidence=medium
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	smil00909 (Sesquiterpenoid and triterpenoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000168

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057781928.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057781928.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781928.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781928.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781928.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4359452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A24,B101,B11,B118,B132,B42,B43,B51,B72,B74,B77,B94,C17,C37,C47,C57,C73,C74,C8,C87,D6
`Chr8:4359468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,C80,D11
`Chr8:4359488`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	41	A18,A2,B106,B108,B122,B123,B126,B128,B129,B130,B14,B140,B2,B21,B23,B24,B25,B26,B28,B46,B5,B60,B66,B85,B88,B96,C14,C29,C31,C4,C44,C48,C51,C55,C6,C64,C66,C82,D10,D7,D8
`Chr8:4359490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:4359519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C80
`Chr8:4359545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,C80,D11
`Chr8:4359547`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B124,C64
`Chr8:4359547`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B124,C64
`Chr8:4359593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,C80,D11
`Chr8:4359664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B51,C42
`Chr8:4359672`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	202	A1,A10,A13,A14,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A5,A6,A7,A8,B1,B100,B101,B102,B104,B105,B108,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B120,B122,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B13,B130,B132,B134,B135,B136,B137,B138,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B3,B30,B31,B32,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B41,B42,B44,B46,B47,B48,B49,B5,B52,B53,B55,B58,B59,B6,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B81,B82,B84,B85,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B94,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C20,C21,C22,C24,C27,C28,C29,C30,C31,C32,C34,C35,C36,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C46,C47,C48,C5,C51,C52,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C71,C72,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D3,D5,D6
`Chr8:4359759`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	48	A23,A25,A5,A6,B111,B113,B124,B131,B134,B137,B138,B139,B15,B16,B19,B27,B5,B52,B59,B65,B67,B76,B78,B84,B89,B91,B93,B98,B99,C1,C10,C16,C21,C24,C28,C3,C30,C41,C44,C46,C5,C54,C66,C71,C80,C84,C87,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781928.1

510 aa

255

510

p450

PF00067 p450 39-496 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781928.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	39	496	3.1e-102	343.5	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925945.1
AATGTAACTCAGTTACTACATCTTCTTTTGCTTCCTATAAATAGATGTGAATTTAGAAGAGAAATAAGAGAAAGTTAAAAAACAAAGGAAAAAAAAAGATCCCGACGCACAAACTGCAAACCCTCGACAACTAAGGGAAAATGGTGGGTGATGTTGAATGGACGTTGACAACTACTTGTGCTGTGGTTTTTCCTCTTGTAATGTTGTTGTTGATGAAAATTTGGAAGAAATCCGAAAATGTTGGCGTTGATCTACCACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000168
ATGGTGGGTGATGTTGAATGGACGTTGACAACTACTTGTGCTGTGGTTTTTCCTCTTGTAATGTTGTTGTTGATGAAAATTTGGAAGAAATCCGAAAATGTTGGCGTTGATCTACCACCAGGCCCTAAAAAACTCCCAATAATCGGATACTTGCACCTCCTTTCAAGTGGTTTGGATTTTCGTGGTTTTCGAGATCTATCCCAACAGTATGGCCCAATAATGCATTTGAAGCTGGGCAGCAGGGACACCATCGTCGTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781928.1
MVGDVEWTLTTTCAVVFPLVMLLLMKIWKKSENVGVDLPPGPKKLPIIGYLHLLSSGLDFRGFRDLSQQYGPIMHLKLGSRDTIVVSSPEIAKEILKDNDPVFAERPQNMLFWHNNSDILFSPYGEYWRQMRKICTLELLSIKNVRSFSSIRNDEVSHLLDSIRVSAGEPVNLTEKIISFMSSIICRTAFGKVSKDKDSVPRLVKEAMGMSATSSVSDIFPSSRIAQALSWGTKLRFMRMCRQLDVILDGIIDDHETNRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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