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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000588`

染色体: Chr08 坐标: 4371643-4374224 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000588`
名称	SmilChr08G000588
描述	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4371643 - 4374224 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997967`
GeneID	`130997967`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997967`
原始查询	`SmilChr08G000588`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
产物	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
Arabidopsis	`AT3G26040` (AT3G26040) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822201] identity=29.1; qcov=0.839; evalue=2.63e-44; confidence=low
Rice	`Os02g0611800` (OsHCT2) - identity=25.7; qcov=0.88; evalue=1.07e-21; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997967

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779388.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057779388.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057779388.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779388.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779388.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4371707`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	52	A10,A22,A23,A24,A25,B11,B112,B114,B122,B129,B130,B139,B38,B41,B47,B55,B58,B65,B73,B74,B75,B76,B77,B79,B82,B91,B93,C11,C13,C17,C18,C27,C3,C30,C32,C37,C38,C39,C41,C44,C5,C61,C62,C64,C66,C75,C8,C83,C86,C87,D1,D3
`Chr8:4372225`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D6
`Chr8:4372225`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D6
`Chr8:4372758`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A16,A20,A25,A7,A8,B10,B112,B17,B23,B28,B3,B49,B75,B77,B79,B82,B94,B99,C1,C16,C17,C34,C37,C39,C43,C56,C66,C69,C78,C86,C87,D4
`Chr8:4374078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr8:4374101`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C80
`Chr8:4374101`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C80
`Chr8:4374127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr8:4374151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr8:4374158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr8:4374173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr8:4374192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779388.1

491 aa

246

491

Transferase

PF02458 Transferase 1-395 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779388.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	1	395	4e-55	187.9	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923405.1
ATGAGTAGCAAGTTGATAAAACCACACACCCCAACCCCTCAAAACCTCAAGAATTACAAGTTATCGTATATAGATGAGCTTGTGGACCCAGGAGAATATTTTGCAGTTGTTCTGTTTTACGAATCGAAACCCGAAGACGGCAGCCTCCAGTTGGAAGAATCACTGGCCAGAATCTTGGTTGATTTCTATCCTCTTGCAGGAAGATTCATCAATAATTATAGTTCGATTGACTGCTGCGACGAGGGAGCCGAGCTCGTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997967
ATGAGTAGCAAGTTGATAAAACCACACACCCCAACCCCTCAAAACCTCAAGAATTACAAGTTATCGTATATAGATGAGCTTGTGGACCCAGGAGAATATTTTGCAGTTGTTCTGTTTTACGAATCGAAACCCGAAGACGGCAGCCTCCAGTTGGAAGAATCACTGGCCAGAATCTTGGTTGATTTCTATCCTCTTGCAGGAAGATTCATCAATAATTATAGTTCGATTGACTGCTGCGACGAGGGAGCCGAGCTCGTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779388.1
MSSKLIKPHTPTPQNLKNYKLSYIDELVDPGEYFAVVLFYESKPEDGSLQLEESLARILVDFYPLAGRFINNYSSIDCCDEGAELVEAEALDVELIELVAKMELDQLDNLLPDQHEAPDIPILSIQITRFSCGGAAVAISVSHKIFDGSSLATFVAAWTDATNPDHAKRVICPSFHLPSLLPSVIRNDNPAPAPAPGSGHKLALKRLSFNKEALTSLKSRISRTNGKPLSGARVVSAVLAEAQFRLDRAKHGRSRSCVVY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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