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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000623`

染色体: Chr08 坐标: 4654111-4657233 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000623`
名称	SmilChr08G000623
描述	uncharacterized SmilChr08G000623
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4654111 - 4657233 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000198`
GeneID	`131000198`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000198`
原始查询	`SmilChr08G000623`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832307]; symbol=AT5G22460; hit=AT5G22460; species=arabidopsis; confidence=high
产物	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832307]; symbol=AT5G22460; hit=AT5G22460; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G22460` (AT5G22460) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832307] identity=54.7; qcov=0.911; evalue=1.36e-143; confidence=high
Rice	`Os12g0152100` - identity=53.6; qcov=0.86; evalue=8.62e-129; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000198

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057781964.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057781964.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781964.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781964.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781964.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4655145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B32,C51,C62
`Chr8:4655271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B51,B61,B75
`Chr8:4656061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B140,B42,B43,C27
`Chr8:4656926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B47,C20,C35,C55
`Chr8:4657028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr8:4657052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:4657058`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B3,C49,C76
`Chr8:4657058`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B3,C49,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781964.1

371 aa

186

371

Hydrolase_4

Abhydrolase_1

Abhydrolase_6

PF12146 Hydrolase_4 92-212 aa PF00561 Abhydrolase_1 97-356 aa PF12697 Abhydrolase_6 98-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781964.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	92	212	9.4e-07	29.1	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057781964.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	97	356	3.9e-12	47.1	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057781964.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	98	356	3e-10	41.8	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925981.1
TATTAATTGAATCCAAATGCAACTTGATTGAGTTTGTTACGAAACGTTTTAAATATGTTTCATGAAGAAGTTTGTTTCTATTTTTGGAGTAAAACATAGAAGTCTAGTGGAAAATCAGTAACAACTTCCTCGTGTTACTGGAAAACACTGTCCCTGTCCCTTTCAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCTGTTTCCTGAAACCCAAGCGCAAATCACTATAAAGGCTGCATTGAAGGAATGAGTACCAGGAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000198
ATGAGTACCAGGAAAATATCTGCTGCGTCAGCTAGGGCTCACACCAGGAAGTCCAGCAATATTGGAAGAAACAACTCCAGATTAACATCAAATATGATTGCCCAGATAGCAGTTGGAGTAATGGTGGGTTGTCTAGGGTATGCTTATTTTGTGATACGGCCTCCGCCTCCTAAAATATGTGGCACCCCCGGTGGTCCTCCGGTGACTTCTCCAAGGGTGAAACTTGACGATGGGAGGCATTTGGCGTACAAGGAGAGGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781964.1
MSTRKISAASARAHTRKSSNIGRNNSRLTSNMIAQIAVGVMVGCLGYAYFVIRPPPPKICGTPGGPPVTSPRVKLDDGRHLAYKERGVAKEEAERRIIISHGYGDSKDFNINLSDELLKELRIYILSFDRAGYGESTPNPARSVKSEAFDIQELADKLGLGPKFYVIGVSIGAYPVYSCLKYIPHRLSGAALVVPFVHYWWKGVPAKLLKEALGTLPVPDQWTYRVARYAPWLFNWWMTQKWFTNLSIMHGSLDVFSRSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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