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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000628`

染色体: Chr08 坐标: 4675584-4709395 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000628`
名称	SmilChr08G000628
描述	60S ribosomal protein L10a
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4675584 - 4709395 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000203`
GeneID	`131000203`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000203`
原始查询	`SmilChr08G000628`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L10a
产物	60S ribosomal protein L10a
Arabidopsis	`AT1G08360` (AT1G08360) Ribosomal protein L1p/L10e family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837356] identity=89.8; qcov=1; evalue=3.82e-132; confidence=high
Rice	`Os01g0860300` - identity=89.3; qcov=1; evalue=4.08e-132; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0015934 (large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00687 (Ribosomal_L1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000203

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781972.1`
2	Nucleolus	核仁	0.80000	`XP_057781973.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057781972.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057781972.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781972.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4675952`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B133,B32,C51,C62
`Chr8:4675952`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B133,B32,C51,C62
`Chr8:4675956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr8:4675994`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	30	A1,A15,A22,A24,A25,A8,B113,B119,B130,B137,B140,B17,B2,B26,B50,B64,B68,B69,B82,B99,C30,C37,C46,C5,C50,C52,C6,C60,C74,C86
`Chr8:4676133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B68,D11
`Chr8:4676169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B32,C51,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781972.1

219 aa

110

219

Ribosomal_L1

PF00687 Ribosomal_L1 21-201 aa

XP_057781973.1

216 aa

108

216

Ribosomal_L1

PF00687 Ribosomal_L1 21-210 aa

XP_057781974.1

216 aa

108

216

Ribosomal_L1

PF00687 Ribosomal_L1 21-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781972.1`	Pfam	`PF00687`	Ribosomal_L1	Domain	21	201	4e-47	161.1	Ribosomal protein L1p/L10e family
`XP_057781973.1`	Pfam	`PF00687`	Ribosomal_L1	Domain	21	210	2.1e-52	178.3	Ribosomal protein L1p/L10e family
`XP_057781974.1`	Pfam	`PF00687`	Ribosomal_L1	Domain	21	210	2.1e-52	178.3	Ribosomal protein L1p/L10e family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925990.1
TGGCCCAAAGGAAAGAAGCCCGTTAGGGTTTATCTTCTGTTACAGATTAGTTATCTTTACACACCCTCACCGCTCTTGCTCACAAACCCTACCAGTGTGTCTCATCAGAAGTAAGCTGCGATTCACGAAATTTTGAAGGATGAGTAAGCTTCAGAGTGAAGCCTTGAGAGAAGCTATCACTCAGATTGTGTCGGACAGTAAGGAGAAAAATAGAAAATTCACTGAGACAGTTGAGCTACAGATTGGGCTGAAAAACTATG...

XM_057925991.1
AAAATAAATTACTACATTAGGCCCAACGGCCCAAAGGAAAGAAGCCCGTTAGGGTTTATCTTCTGTTACAGATTAGTTATCTTTTCACACCCTCACCGCTCTTGCTCACAAACCCTACCAGTGTGTCTCATCAGAAGTAACCTGCGATTCACGAAATTTTGAAGGATGAGTAAGCTTCAGAGTGAAGCCTTGAGAGAAGCTATCACTCAGATTGTGTCGGACAGTAAGGAGAAAAATAGAAAATTCACTGAGACAGTTGA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131000203
ATGAGTAAGCTTCAGAGTGAAGCCTTGAGAGAAGCTATCACTCAGATTGTGTCGGACAGTAAGGAGAAAAATAGAAAATTCACTGAGACAGTTGAGCTACAGATTGGGCTGAAAAACTATGACCCGCAGAAGGATAAGCGTTTTAGCGGTTCTGTTAGGTTGCCACATATTCCCCGGCCAAAAATGAAGATTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCATGTGGAAGAGGCTGAAAAAATTGGTTTGGAGTCCATGGATGTGGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057781972.1
MSKLQSEALREAITQIVSDSKEKNRKFTETVELQIGLKNYDPQKDKRFSGSVRLPHIPRPKMKICMLGDAQHVEEAEKIGLESMDVEALKKLNKNKKLVKKLAKKYHAFLASEAVIKQIPRLLGPGLNKAGKFPTLVTHQESLESKVNETKATIKFQLKKVLCMGVAVGNLDMEEKQLFQNIQMSVNFLVSLLKKNWQNVSILLCFVSLLQISIKSLEC

XP_057781973.1
MSKLQSEALREAITQIVSDSKEKNRKFTETVELQIGLKNYDPQKDKRFSGSVRLPHIPRPKMKICMLGDAQHVEEAEKIGLESMDVEALKKLNKNKKLVKKLAKKYHAFLASEAVIKQIPRLLGPGLNKAGKFPTLVTHQESLESKVNETKATIKFQLKKVLCMGVAVGNLDMEEKQLFQNIQMSVNFLVSLLKKNWQNVRCLYLKSTMGKPQRIF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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