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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000637`

染色体: Chr08 坐标: 4749063-4749971 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000637`
名称	SmilChr08G000637
描述	uncharacterized SmilChr08G000637
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4749063 - 4749971 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000213`
GeneID	`131000213`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000213`
原始查询	`SmilChr08G000637`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823563]; symbol=AT3G44380; hit=AT3G44380; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823563]; symbol=AT3G44380; hit=AT3G44380; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G44380` (AT3G44380) Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823563] identity=66.1; qcov=0.957; evalue=1.79e-82; confidence=high
Rice	`Os08g0558300` - identity=57.3; qcov=0.962; evalue=1.73e-66; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009269 (response to desiccation)
KEGG	-
Pfam	PF03168 (LEA_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000213

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057781985.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057781985.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057781985.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057781985.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781985.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4749373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B77,C24,C56
`Chr8:4749587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr8:4749595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B56,B96,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781985.1

185 aa

185

LEA_2

PF03168 LEA_2 59-157 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781985.1`	Pfam	`PF03168`	LEA_2	Domain	59	157	1.4e-12	48.7	Late embryogenesis abundant protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926002.1
TTGCTATTTGGGAACAAAAAGAAAAGTGCTGTTATTATATCACGCGTAATTTCACTGTTAATGGGAAAGTGGTAGTCCGCGCCGCCCATCCTTTATTTCCGCTACTAACATAAACCACGTTTTTAATGATACATATTAGAATCCTACATTCTACTACCACAACAACAATATATTATACTACTCACAAACTCAGAATTGAAAATTGAGTCGAAAAGCAAGGGCAGTTCCGTCATTTGACTGAAGTTGACTCCCTTATCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000213
ATGGGCAAAGGGAAGAAGTTCAGCTGGGGATCGGCCCTGGTGGGCGCGGCGGCGGCGTCGGCCGCGAGCCTGGTGCTGTCGTCGAGGCCGCGCGACCCGACGTTCCACCTGATCTCCATCGACATCACCTCCTTCAAGATGAACTTCCCGGTGCTGGACGCGGAGACGATCCTGACCGTCCACGTCACCAACCCCAACGTGGCCCCCATCCGCTACTCCGACACCGTGATGTCCATCTACTACGCCGGCGCGCTCCTCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781985.1
MGKGKKFSWGSALVGAAAASAASLVLSSRPRDPTFHLISIDITSFKMNFPVLDAETILTVHVTNPNVAPIRYSDTVMSIYYAGALLGSAPVEAGSQPPRSCQLLRLPARLSGLQLAHHAKSFVADVGRREMVLDSTVDISGTAKVLWWNHGFKVHVDSHIVVDPVYLDVIDQENKSKLELFVRNS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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